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Structural Chemistry Involved in Discrimination of Diatomic Ligands and Transduction Mechanism of Sensed Information of Gas Sensing Heme Proteins

Structural Chemistry Involved in Discrimination of Diatomic Ligands and Transduction Mechanism of Sensed Information of Gas Sensing Heme Proteins
双原子配体识别的结构化学及气敏血红素蛋白传感信息的转导机制
批准号：
19350089
负责人：
KITAGAWA Teizo
金额：
$12.06万
依托单位：
Toyota Physical & Chemical Research Institute
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2007
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2007 至 2008
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19350089/
关键词：
生体分子生物物理生体生命情報学振動分光学ヘム蛋白質シトクロム酸化酵素生体分子科学共鳴ラマン散乱ガスセンサ-蛋白アロステリック効果ガスセンサー蛋白質蛋白質ダイナミクス

项目摘要

项目成果

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O_2分子センサーであるEc DOS とHemAT-Bs を詳しく調べた。これらの蛋白では、N 末端側にあるFe(II)ヘムにO_2,CO,或はNO 等の2原子分子が結合するが,ターゲット分子が結合した時のみC 末端側で機能(Ec DOS ではリン酸ジエステル化活性、HemAT-Bsでは次の蛋白に情報伝達)を発揮する。蛋白の構造変化を紫外共鳴ラマン法で,ヘムの構造変化を可視共鳴ラマン法で検出し、蛋白の識別法と情報伝達の構造化学を解明した。呼吸酵素のプロトンポンプ機構についても調べた
英文摘要
O_2分子センサーであるEc DOS とHemAT-Bs を詳しく調べた。これらの蛋白では、N 末端側にあるFe(II)ヘムにO_2,CO,或はNO 等の2原子分子が結合するが,ターゲット分子が結合した時のみC 末端側で機能(Ec DOS ではリン酸ジエステル化活性、HemAT-Bsでは次の蛋白に情報伝達)を発揮する。蛋白の構造変化を紫外共鳴ラマン法で,ヘムの構造変化を可視共鳴ラマン法で検出し、蛋白の識別法と情報伝達の構造化学を解明した。呼吸酵素のプロトンポンプ機構についても調べた
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会议论文
酸素分子センサー蛋白、EcDOS, のセンシング機構の構造化学 : 共鳴ラマン分光法による研究
氧分子传感器蛋白传感机制的结构化学，EcDOS：共振拉曼光谱研究
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [北川禎三,SamirEl-Mashtoly, 清水 透]
通讯作者： 清水 透
Structural Chemistry of Sensing Mechanism of O2-sensor Protein, Ec DOS, Revealed with Resonance Raman Spectroscopy
共振拉曼光谱揭示 O2 传感器蛋白 Ec DOS 传感机制的结构化学
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [T. Kitagawa, S. F. El-Mashtoly, and T. Shimizu]
通讯作者： and T. Shimizu
A peroxide bridge between Fe and Cu ions in the O2 reduction site of fully oxidized cytochrome c oxidase could suppress the proton pump
DOI： 10.1073/pnas.0806391106
发表时间： 2009-02-17
期刊： PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子： 11.1
作者： [Aoyama, Hiroshi, Muramoto, Kazumasa, Yoshikawa, Shinya]
通讯作者： Yoshikawa, Shinya
Roles of Arg97 and Tyr113 in regulation of distal ligand binding to heme in Ec Dos protein : Resonance Raman and mutation study
Arg97 和 Tyr113 在调节 Ec Dos 蛋白中远端配体与血红素结合中的作用：共振拉曼和突变研究
DOI： --
发表时间： 2008
期刊： J. Biol.Chem 283
影响因子： --
作者： [El-Mashtoly, S.F., S. Nakashima, A. Tanaka, T. Shimizu, and T. Kitagawa]
通讯作者： and T. Kitagawa
共 15 条
    UV resonance Raman investigation on detection of higher order structural changes of heme proteins and elucidation of functional regulation mechanism
    • 批准号：
      24350086
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.73万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      KITAGAWA Teizo
    • 依托单位：
      University of Hyogo
    Structural Chemistry on Information Transduction through Allosteric Effects in Heme Proteins
    • 批准号：
      21350098
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $12.15万
    • 财政年份：
      2009
    • 负责人：
      KITAGAWA Teizo
    • 依托单位：
      University of Hyogo
    Development of Detection Methods of Dynamical Higher Order Structures of Proteins and Its Application to Elucidation of Structure-Function Relations of Proteins.
    Time-Resolved Vibrational Spectroscopic Investigation of Ultrafast Protein Dynamics Coupled with Photoreaction
    国内基金
    海外基金
    单分子生物物理技术发展与应用
    • 批准号：
      JCZRQT202500030
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2025
    • 负责人：
    • 依托单位：
      武汉大学
    射频电磁暴露下细胞膜界面生物物理信号调控机制研究
    • 批准号：
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2025
    • 负责人：
    • 依托单位：
      南京医科大学
    蛾气味受体分子识别机制的计算生物物理研 究
    • 批准号：
      Z24C050004
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2024
    • 负责人：
      王勇
    • 依托单位：
      浙江大学
    基于观测和CMIP6/LUMIP试验的毁林/造林生物物理效应模拟评估和约束研究
    • 批准号：
      42375115
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      50万元
    • 批准年份：
      2023
    • 负责人：
      葛骏
    • 依托单位：
      南京大学