Structural Chemistry Involved in Discrimination of Diatomic Ligands and Transduction Mechanism of Sensed Information of Gas Sensing Heme Proteins

双原子配体识别的结构化学及气敏血红素蛋白传感信息的转导机制

• 批准号: 19350089
• 负责人: KITAGAWA Teizo
• 金额: $ 12.06万
• 依托单位: Toyota Physical & Chemical Research Institute
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19350089/
• 关键词: 生体分子; 生物物理; 生体生命情報学; 振動分光学; ヘム蛋白質; シトクロム; 酸化酵素; 生体分子科学; 共鳴ラマン散乱; ガスセンサ-蛋白; アロステリック効果; ガスセンサー蛋白質; 蛋白質ダイナミクス

O_2分子センサーであるEc DOS とHemAT-Bs を詳しく調べた。これらの蛋白では、N 末端側にあるFe(II)ヘムにO_2,CO,或はNO 等の2原子分子が結合するが,ターゲット分子が結合した時のみC 末端側で機能(Ec DOS ではリン酸ジエステル化活性、HemAT-Bsでは次の蛋白に情報伝達)を発揮する。蛋白の構造変化を紫外共鳴ラマン法で,ヘムの構造変化を可視共鳴ラマン法で検出し、蛋白の識別法と情報伝達の構造化学を解明した。呼吸酵素のプロトンポンプ機構についても調べた

O_2 sub-sub-sub These proteins combine with Fe(II), O_2, CO, or NO at the N-terminal side, and develop functions at the C-terminal side (Ec DOS, Hep, Hep). Protein structural transformation: UV resonance method; protein structural transformation: visual resonance method; protein identification method; structural chemistry method; Respiratory enzymes are regulated by mechanisms.

项目成果

酸素分子センサー蛋白、EcDOS, のセンシング機構の構造化学 : 共鳴ラマン分光法による研究

氧分子传感器蛋白传感机制的结构化学，EcDOS：共振拉曼光谱研究

• 发表时间: 2008
• 作者: 北川禎三,SamirEl-Mashtoly;清水 透
• 通讯作者: 清水 透

Structural Chemistry of Sensing Mechanism of O2-sensor Protein, Ec DOS, Revealed with Resonance Raman Spectroscopy

共振拉曼光谱揭示 O2 传感器蛋白 Ec DOS 传感机制的结构化学

• 发表时间: 2008
• 作者: T. Kitagawa;S. F. El-Mashtoly;and T. Shimizu
• 通讯作者: and T. Shimizu

A peroxide bridge between Fe and Cu ions in the O2 reduction site of fully oxidized cytochrome c oxidase could suppress the proton pump

• DOI: 10.1073/pnas.0806391106
• 发表时间: 2009-02-17
• 期刊: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
• 影响因子: 11.1
• 作者: Aoyama, Hiroshi;Muramoto, Kazumasa;Yoshikawa, Shinya
• 通讯作者: Yoshikawa, Shinya

Roles of Arg97 and Tyr113 in regulation of distal ligand binding to heme in Ec Dos protein : Resonance Raman and mutation study

Arg97 和 Tyr113 在调节 Ec Dos 蛋白中远端配体与血红素结合中的作用：共振拉曼和突变研究

• 发表时间: 2008
• 期刊: J. Biol.Chem 283
• 作者: El-Mashtoly;S.F.;S. Nakashima;A. Tanaka;T. Shimizu;and T. Kitagawa
• 通讯作者: and T. Kitagawa

Protein conformation changes of HemAT-Bs upon ligand binding probed by ultraviolet resonance Raman spectroscopy

• DOI: 10.1074/jbc.m709209200
• 发表时间: 2008-03-14
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: El-Mashtoly, Samir F.;Gu, Yuzong;Kitagawa, Teizo
• 通讯作者: Kitagawa, Teizo