A NMR Study of Individual Residues of Proteins in a Random Coil State

无规卷曲状态蛋白质单个残基的核磁共振研究

• 批准号: 19540431
• 负责人: NODA Yasuo
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Kwansei Gakuin University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19540431/
• 关键词: 生物物理; タンパク質; リゾチーム; 核磁気共鳴; ジスルフィド結合; ランダムコイル; 重水素交換; ジメチルスルホキシド

2SS[6-127, 64-80] variant of lysozyme which has two disulfide bridges and lacks the other two disulfide bridges was quite unstructured in water, but a part of the polypeptide chain was gradually frozen into a native-like conformation with increasing glycerol concentration. It was monitored from the protection factors of amide hydrogens against H/D exchange by means of NMR spectroscopy. With increasing glycerol concentration, some selected regions were further protected. The highly protected residues were included in A-, Band C-helices and β3-strand, and especially centered on Ile 55 and Leu 56. In 2SS[6-127, 64-80], long-range interactions were recovered due to the preferential hydration by glycerol in the hydrophobic box of the α-domain.

2SS[6-127，-80]变异型溶菌酶具有两个二硫键，没有另外两个二硫键，在水中很无结构，但随着甘油浓度的增加，部分多肽链逐渐冻结为天然构象。用核磁共振波谱从酰胺氢对H/D交换的保护因子中监测到了这一点。随着甘油浓度的增加，部分选定区域受到进一步保护。高度保护的残基包括A-、C-带螺旋和β3-链，尤其集中在Ile55和Leu56上。在2SS[6-127，-80]中，由于甘油在α-结构域疏水盒中的优先水化作用，恢复了长程相互作用。

项目成果

NMR分光法を用いたジスルフィド結合を欠損させたデンプン結合ドメインのリフォールディング中間体の構造解析

使用核磁共振波谱法对缺乏二硫键的淀粉结合域的重折叠中间体进行结构分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 杉本華幸;野田康夫;瀬川新一
• 通讯作者: 瀬川新一

リゾチームのS-S結合欠損変異体における残留非ランダム構造

溶菌酶 S-S 键缺陷突变体中残留的非随机结构

• 发表时间: 2009
• 作者: 笠井健一;奈良間邦成;野田康夫;橘秀樹;瀬川新一;笠井健一
• 通讯作者: 笠井健一

モルテングロビュール状の変性状態においてピロリドンカルボキシルペプチダーゼ(PCP)の折りたたみ反応は順次進行していく(The folding of PCP(Pyrrolidone Carboxyl Peptidase) sequentially proceeds in the denatured state similar to the stage of molten globule)

PCP（吡咯烷酮羧基肽酶）的折叠在类似于熔球阶段的变性状态下依次进行。

• 发表时间: 2008
• 作者: 横田洋平;吉田篤史;野田康夫;油谷克英;瀬川新一
• 通讯作者: 瀬川新一

The confirmation of the denatured structure of pyrrolidone carboxyl peptidase under nondenaturing conditions : difference in helix propensity of two synthetic peptides with single amino acid substitution.

非变性条件下吡咯烷酮羧基肽酶变性结构的确认：具有单个氨基酸取代的两种合成肽的螺旋倾向的差异。

• 发表时间: 2008
• 期刊: Proteins : Structure, Function, and Bioinformatics 71
• 作者: Umezaki;T.;Iimura;S.;Noda;Y.;Segawa;S.;Yutani;K;Umezaki T
• 通讯作者: Umezaki T

ジスルフィド結合を欠損させたデンプン結合ドメインのリフォールディング中間体のNMRによる解析

缺乏二硫键的淀粉结合结构域的重折叠中间体的核磁共振分析

• 发表时间: 2009
• 作者: 杉本華幸;野田康夫;瀬川新一;杉本華幸
• 通讯作者: 杉本華幸