マイクロアレイを用いたセレウス菌の病原遺伝子保有状況ならびにその発現解析
蜡样芽胞杆菌致病基因占有状况及表达的微阵列分析
基本信息
- 批准号:19590442
- 负责人:
- 金额:$ 3万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2007
- 资助国家:日本
- 起止时间:2007 至 2008
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
セレウス菌Bacillus cereusはヒトにおいて食中毒の原因菌となる病原細菌である。セレウス菌による食中毒は臨床的に嘔吐型と下痢型に分類される。我々は嘔吐型食中毒事例より分離されたセレウス菌の全ゲノム解析から嘔吐毒素であるセレウリドの合成系が染色体ではなくプラスミド上にコードされていることを見いだした。さらに嘔吐型セレウス菌と非嘔吐型セレウス菌のセレウスグループ細菌における遺伝的背景を探る目的で、近年細菌の分子疫学に汎用されるmultilocus sequence typingという手法を用いて染色体の解析を行ったところ、嘔吐型セレウス菌が4つのsequence type(ST26,165,144,164)に集約され非常にクロナリティの高い集団を形成するのに対し、非嘔吐型(嘔吐毒素を持たない)のセレウス菌株は多様性に富むことがわかった。そこで、染色体の遺伝子構成をさらに検討する目的でセレウス菌NC7401株の全ゲノム配列の情報をもとにDNAマイクロアレイを作成し、comparative genomic hybridizationにより嘔吐型、ならびに非嘔吐型セレウス菌の解析を行った。MLSTの結果と同様CGHにおいても嘔吐型のセレウス菌同士は相同性が高いのに対し、非嘔吐型は株間で相同性が低い結果となった。特に嘔吐型セレウス菌は近縁菌の炭疽菌とも高い相同性を示すことから、嘔吐型の詳細な検討により病原性の発現に関与する遺伝子の解明にも繋がると考えられるため、現在データの詳細な解析をおこなっているところである。
Bacillus cereus is the cause of food poisoning. The food poisoning is classified as vomiting type and diarrhea type. In the case of vomiting type food poisoning, we isolated the whole genome of the bacteria, analyzed the whole genome of vomiting toxin, and synthesized the chromosome. The aim of this study is to explore the background of the gene expression of vomiting and non-vomiting bacteria. In recent years, the molecular epidemiology of bacteria has been widely used in multifocus sequence typing. The method of chromosome analysis has been used in the analysis of vomiting and non-vomiting bacteria.(ST26,165,144,164) The high concentration of highly pathogenic and non-vomiting (vomiting toxin) strains is highly concentrated, and the diversity of these strains is rich. For this purpose, the chromosome gene composition of the strain NC7401 was analyzed by DNA sequencing and comparative genomic hybridization. The results of MLST and CGH are similar. The similarity between vomiting and vomiting strains is high. The similarity between non-vomiting strains is low. A detailed analysis of the pathogenicity of a particular vomiting-type bacterium is related to the development of its pathogenicity.
项目成果
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