Analysis of SNPs susceptible to Parkinson's disease

帕金森病易感 SNP 分析

• 批准号: 19590990
• 负责人: MIZUTA Ikuko
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19590990/
• 关键词: パーキンソン病; 一塩基多型; 疾患感受性遺伝子; 関連解析

孤発性パーキンソン病(PD)の発症には、複数の遺伝子および環境因子が関与すると考えられている。これまで我々は121 個の候補遺伝子上の268 個のSNP_s(一塩基多型)を用いた大規模な関連解析により、α-synuclein (P=5.1x10^<-14>, オッズ比 OR = 2.23)を確実なパーキンソン病感受性遺伝子として同定し、報告した。また、白人でPD との関連が報告されていたFGF20 (P =0.0053, OR = 1.24)の日本人での再現性も確認した。本研究では、新たなPD 遺伝子同定のために、さらに候補遺伝子を増やして合計137 個の候補遺伝子上の302 個のSNP_sの関連解析を行った。遺伝子型タイピングは患者1403人、対照1938人を対象にTaqMan 法で行った。その結果、新たなPD 感受性遺伝子calbindin1 を同定した (P = 7.1x10^<-5>, OR = 1.34)。さらに、α-synuclein,calbindin1, FGF20の3個のPD遺伝子のうち、最も強くPD と関連するα-synuclein を中心にして、統計学的組み合わせ解析を行った。calbindin1 はα-synuclein のリスクを持たない群でPDと強く相関し(OR = 1.70)、逆にFGF20 はα-synuclein のリスクアレルを持つ群でPD とより強く関連した(OR = 1.76)。Calbindin1 はカルシウム結合蛋白であり、PD 患者の黒質でcalbindin1陰性神経の脱落が陽性神経の脱落よりも強いことから、神経保護作用を持つと考えられている。組み合わせ解析から、calbindin1 はα-synuclein とは独立に、一方、FGF20 はα-synuclein と相乗的に、PD 発症に関与していることが示唆される。

The development of isolated disease (PD) is related to multiple genetic factors and environmental factors. The results showed that 268 SNPs (one-to-many types) on 121 candidate genes were identified by large-scale association analysis, and α-synuclein (P=5.1x10^<-14>, OR = 2.23) was used to determine the susceptibility genes of the disease. The association between PD and FGF20 (P =0.0053, OR = 1.24) was reported for white and Japanese. In this study, 302 SNP_s from 137 candidate genes were analyzed for association between new and new PD genes. 1403 patients and 1938 patients were treated by TaqMan method. The results showed that calbindin1 was the same as calbindin1 (P = 7.1x10^<-5>, OR = 1.34). The analysis of the three PD genes, α-synuclein,calbindin1 and FGF20, was performed statistically. Calbindin1 α-synuclein is strongly correlated (OR = 1.70), while FGF20 α-synuclein is strongly correlated (OR = 1.76). Calbindin1 is a protein binding protein that binds to the brain. Calbindin1 is a protein binding protein that binds to the brain. Calbindin1 is a protein binding protein that binds to the brain. Calbindin 1 is a protein binding protein that binds to the brain. The combination analysis, calbindin1, α-synuclein, FGF20, α-synuclein, PD, PD

项目成果

Calbindin 1, fibroblast growth factor 20, and α-synuclein in sporadic Parkinson's disease

• DOI: 10.1007/s00439-008-0525-5
• 发表时间: 2008-08-01
• 期刊: HUMAN GENETICS
• 影响因子: 5.3
• 作者: Mizuta, Ikuko;Tsunoda, Tatsuhiko;Toda, Tatsushi
• 通讯作者: Toda, Tatsushi

多数の候補遺伝子アプローチによるパーキンソン病感受性遺伝子calbindin1の同定日本人類遺伝学会

使用多候选基因方法鉴定帕金森病易感基因 calbindin1日本人类遗传学会

• 发表时间: 2007
• 作者: 水田依久子;佐竹渉;角田達彦;長谷川一子;渡邊雅彦;武田篤;服部信孝;山本光利;村田美穂;戸田達史
• 通讯作者: 戸田達史

Mutations for Gaucer disease confer highsusceptibility to Parkinson disease

戈塞病突变导致帕金森病高度易感

• 发表时间: 2009
• 期刊: Arch Neurol 66
• 作者: Mitsui J;Mizuta I;Toyoda A;Ashida R;Takahashi Y;Goto J;Fukuda Y;Date H;Iwata A;Yamamoto M;Hattori N;Murata M;Toda T;Tsuji S.
• 通讯作者: Tsuji S.

Toda Genome-wide association study of Parkinson's disease by550K SNP Array

户田通过 550K SNP 阵列进行帕金森病全基因组关联研究

• 发表时间: 2008
• 作者: W. Satake;Y. Nakabayashi;I. Mizuta;T. Kawaguchi;T. Tsunoda;M. Kubo;S. Sakoda;M. Yamamoto;N. Hattori;M. Murata;Y. Nakamura;T. Gasser;A.B. Singleton;T.
• 通讯作者: T.

多数の候補遺伝子アプローチによるパーキンソン病感受性遺伝子calbindin1の同定

使用多候选基因方法鉴定帕金森病易感基因 calbindin1

• 发表时间: 2007
• 作者: 水田依久子;佐竹渉;角田達彦;長谷川一子;渡邊雅彦;武田篤;服部信孝;山本光利;村田美穂;戸田達史
• 通讯作者: 戸田達史