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A study on host gene mutations associated with severity of RSV infection

宿主基因突变与 RSV 感染严重程度相关的研究

基本信息

批准号：
19591258
负责人：
TSUTSUMI Hiroyuki
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Sapporo Medical University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至 2008
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19591258/
关键词：
RSウイルス分子疫学細気管支炎 TLR4 IL-4 RSウイルス下気道炎 IL4 RSV RSV細気管支炎

项目摘要

本研究では、本邦の乳幼児のRSV感染症の重症度と、ホストのTLR4、IL-4, IL-4Rα, IL-10, RANTESなど自然免疫に関係するTLR、サイトカイン、ケモカイン遺伝子の多型との関係について明らかにすることを目的とした。札幌医科大学小児科学教室で1980年以降20数年間にわたって保存されているRSウイルス下気道炎に罹患した乳幼児の臨床レコードを掘り起こし、先ず、RSV細気管支炎、RSV肺炎など下気道炎のリスクファクターとして明らかになっている事柄について検討した。つまり、早産未熟児であったか、先天性心疾患を有していたか、あるいは新生児期に呼吸障害を呈し慢性肺疾患などであったかなどである。それら、明らかなリスクファクターを有している乳幼児を除いた児50症例を対象としてピックアップした。対照群としてはRSV感染で受診歴の無い幼児、つまりRSV感染が軽症に経過したと考えられる幼児50名を当てた。次に、対象としてピックアップされた乳幼児より分離・保存されたRSV、あるいは気道分泌液から抽出されたRNAから、PCRによりRSVのエンベロープ蛋白の一つで変異に富むG蛋白遺伝子を検出し、PCR産物のダイレクトシークエンス法より、RSVの遺伝子型(グループA, A1~A7 ; グループB, B1~B4)の決定を行った。しかし、特定のRSV遺伝子型とRSV感染重症例との関係は明らかでなかった。次に、気道分泌液よりホストのDNAを抽出し、自然免疫応答のキーとなるTLR4の遺伝子のLPSへの反応性を低下させる1塩基置換(SNPs)(Asp299Gly、Thr399Ile)について、PCR産物のダイレクトシークエンス法にて解析した。更に変異の頻度について検討したがRSウイルス重症群と対象群との間にはいずれの遺伝子変異についても有意な違いを認めることはできなかった。現在、RSウイルス感染症の重症化への関与が考えられているサイトカイン・ケモカインの遺伝子、つまりIL-4(-590アリル)、IL-4Rα(Q551R)、IL-10(-592C、-592A)、RANTES(-2459G、-2254T)等のSNPsについても同様にPCR産物のダイレクトシークエンス法により検討を進めているが、やはり重症群と対照群との間には有意な差を認めることはできていない。

This study aims to investigate the relationship between the severity of RSV infection, TLR4, IL-4, IL-4R α, IL-10, RANTES and natural immunity in infants in the country. The Department of Pediatrics, Sapporo Medical University, has been preserved for more than 20 years since 1980. The clinical symptoms of respiratory tract inflammation in infants and young children have been investigated. Premature, premature, congenital heart disease, neonatal respiratory impairment, chronic lung disease In addition to the above, there are 50 cases of breast cancer. There were no children diagnosed with RSV infection, and 50 children diagnosed with RSV infection. In addition, RSV was isolated, preserved, and purified from the secretion fluid of RSV. PCR was used to detect the G-rich protein gene of RSV. PCR products were identified by PCR method. RSV gene types (A, A1-A7 ; B, B1-B4) were determined. The relationship between RSV infection and severe cases is clear. Next, DNA extraction from secretion fluid, natural immune response, LPS response reduction of TLR4 gene, 1-mer base substitution (SNPs)(Asp299Gly, Thr399Ile), PCR product analysis by PCR method. In addition, the frequency of different types of information is different from that of serious types of information. Current status, RS infection severity, IL-4(-590 ° R), IL-4R α(Q551R), IL-10 SNPs such as (-592C,-592A), RANTES(-2459G,-2254T), etc. are included in the analysis of PCR products of the same type.