異なる温度環境は回遊性魚類の遺伝的集団分化を引き起こすのか？

不同的温度环境会导致洄游鱼类的遗传种群分化吗？

• 批准号: 16J05519
• 负责人: 古川 誠志郎
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Fisheries Research and Education Agency (2017)Tohoku University (2016)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2016-04-22 至 2019-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16J05519/
• 关键词: 集団構造; 回遊魚; 回遊性魚類; RAD-seq; シイラ

本研究では、広域を回遊する魚類の温度適応性に注目して、その集団分化と移動生態解明を試みる。一般に、熱帯域では年間を通して高水温であるのに対して、温帯域では夏季の高水温から冬季の低水温に至る水温の季節変化がある。このような水温環境の南北勾配が地理的障壁のない回遊魚の遺伝的集団分化を引き起こすのかを、熱帯域から温帯域にかけて全球的に漁獲されているシイラを用いて研究を行った。本研究では本種の集団間の遺伝構造を見出すためにRADシーケンシング（RAD-seq）を行う。これまで、ゲノミックリソースの整っていない本種のような非モデル生物において、集団間の変異を見出すのに十分な数の遺伝マーカーを得るのには多大な時間とコストがかかっていた。RAD-seqでは、制限酵素で切断したゲノムDNAの断片を次世代シーケンサーで読むことにより、核ゲノム中に広く大量に分布する1塩基多型（SNP）を探索することができる。この手法を用いることによって、ゲノム情報の乏しい魚種からも集団間の変異を見出すのに十分な遺伝マーカーの開発が可能となる。研究を開始した当初は、日本周辺に限定して筋肉サンプルを収集する予定であったが、より顕著に温度環境の異なる海域に生息する個体を収集するために、調査海域を北西太平洋及びハワイ諸島周辺海域に拡大して収集を実施することにした。

In this study, temperature monitoring, cluster differentiation and ecological interpretation experiments were carried out in this study. In general, the temperature of the summer is higher than that of the summer, and that of the summer is higher than that of the summer, and that of the winter is lower than that of the summer to that of the summer. The distribution of geographical barriers in the north-south of the water temperature environment has led to the development of environmental protection facilities around the world, such as environmental protection, environmental protection and environmental protection. The purpose of this study is to create a real-time RAD trading platform (RAD-seq) in this market. This kind of equipment is used in non-commercial biological equipment, and in the middle of the room, the output temperature is 10 percent, and how long it takes to do so. RAD-seq restriction enzyme cut-off enzyme cut-off enzyme fragment, next-generation enzyme cut-off fragment, nuclear restriction enzyme fragment and nuclear enzyme fragment were distributed in large quantities (SNP) to explore gene polymorphism. In this way, you can use a lot of information and information to make sure that there are many different kinds of information, and that there is a great deal of information about how much you can do. At the beginning of the study, the study was conducted in the early days of the study, in the week of Japan, and in the temperature environment, the temperature environment, the sea area, the northwest Pacific Ocean and the surrounding sea area.