飼料効率向上のための新規セルロース分解菌の分離

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昨年度までに実施した旧来法で培養困難なルーメン細菌の分離・培養で得られたルーメン細菌129菌株から９菌株を選択し、農業分野の温室効果ガスに関するグローバル・リサーチ・アライアンス（ＧＲＡ）の家畜分野が実施する国際共同プロジェクト（Hungate1000）においてゲノム解析を実施した。その結果、７菌株（Anaerovibrio sp. RM50、Lachnospiraceae bacterium G11、Lachnospiraceae bacterium G41、Lachnospiraceae bacterium RM5、Prevotella sp. RM4、Ruminobacter sp. RM87、Ruminococcaceae bacterium P7）の全ゲノム配列が決定され、公開された（http://genome.jgi.doe.gov/TheHunmicrobiome/TheHunmicrobiome.info.html）。これらの菌株のゲノム配列には、炭水化物（デンプン、セルロース、キシラン等）の加水分解酵素をコードする遺伝子が含まれていた。また、GRAの別の国際プロジェクト（Global Rumen Census）の研究成果で示された主要ルーメン細菌トップ５０に、これらの菌株のうち、Ruminobacter sp. RM87とRuminococcaceae bacterium P7が含まれていたことから（１）、牛などの反すう家畜の消化生理で重要なルーメン細菌の主要メンバーとなっている２菌株の分離と全ゲノム配列の決定が達成されたことが明らかになった。１）Henderson, Gemma, et al. "Rumen microbial community composition varies with diet and host, but a core microbiome is found across a wide geographical range." Scientific reports 5: 14567 (2015).