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蛋白質のフォールディング中間体構造を用いた、フォールディング能に関する研究

蛋白質のフォールディング中間体構造を用いた、フォールディング能に関する研究
利用蛋白质折叠中间结构研究折叠能力
批准号：
08J00653
负责人：
田中 俊一
金额：
$0.77万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2008
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2008 至 2009
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08J00653/
关键词：
超好熱古細菌サチライシン蛋白質フォールディングプロペプチドカルシウムイオン

项目摘要

项目成果

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本研究では、超好熱古細菌Thermococcus kodaraensis由来サチライシン(Tk-subtilisin)のフォールディング中間体構造の解析と、Foldability欠落因子の探索を行うことで"蛋白質のFoldabilityをもたらす重要な因子"の解明を目的とした。本年度ではその中間体構造の決定には至らなかったが、種々の部位特異的変異体を用いた生化学的解析および結晶構造解析により、"重要な因子の同定に成功した"。具体的には、プロペプチドと成熟体が相互作用する界面に注日し、その結合を欠損させるような変異体蛋白質を数種類構築した。これらの蛋白質を用いた解析から、相互作用界面に存在する成熟体側の酸性アミノ酸残基(グルタミン酸)をアラニンに置換した変異体蛋白質は、プロペプチドの補助によるフォールディング能を完全に失うことが明らかになった。一方で、他の変異体蛋白質に関しては、ある程度のフォールディング能の低下は見られるものの、完全に失うことは無かった。これらの解析結果から、相互作用界面に存在するグルタミン酸とプロペプチドとの結合がTk-subtihsinのFoldabilityをもたらす重要な因子であることを明らかにした。また、このグルタミン酸およびその側鎖が水素結合を形成するプロペプチド側の疎水性アミノ酸残基は、対象酵素のホモログ(サチライシンファミリー)に非常に良く保存されていることも明らかにした。このことから、本研究において明らかにした因子がサチライシン全般に普遍的に存在することを提唱した。以上の研究成果から、蛋白質のフォールディング能を決定付ける普遍的な因子について、新たな知見を得ることに成功した。
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会议论文
プロテアーゼの製造方法、並びにプロテアーゼ溶液およびプロテアーゼのプロ体溶液
蛋白酶的制造方法、蛋白酶溶液及蛋白酶原体溶液
DOI： --
发表时间： 2009
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Study on the Ca^<2+>-dependent maturation mechanism of subtilisin from a hyperthermophilic archaeon
超嗜热古菌枯草杆菌蛋白酶Ca^2依赖性成熟机制的研究
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [田中, 俊一]
通讯作者： 俊一
Subtilisin-like serine protease from hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakaraensis with N- and C-terminal propeptides
DOI： 10.1093/protein/gzp092
发表时间： 2010-05-01
期刊： PROTEIN ENGINEERING DESIGN & SELECTION
影响因子： 2.4
作者： [Foophow, T., Tanaka, S., Kanaya, S.]
通讯作者： Kanaya, S.
超好熱古細菌由来シグナルペプチドペプチダーゼの構造解析
超嗜热古菌信号肽肽酶的结构分析
DOI： --
发表时间： 2009
期刊：
影响因子： --
作者： [Foophow, Tita, 上田泰徳, 八坂能郎, 岡元将太]
通讯作者： 岡元将太
共 12 条
    抗体ミメティックで切り拓くセレノプロテインPの構造解析と腫瘍悪性化作用の抑制戦略
    • 批准号：
      24K08717
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $3.0万
    • 财政年份：
      2024
    • 负责人：
      田中 俊一
    • 依托单位：
      Kyoto Prefectural University
    人工結合タンパク質を基盤とする新しいタンパク質構造安定化戦略の創成
    • 批准号：
      21K05386
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.75万
    • 财政年份：
      2021
    • 负责人：
      田中 俊一
    • 依托单位：
      Kyoto Prefectural University
    光波利用センシング
    • 批准号：
      01101012
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Special Project Research
    • 资助金额：
      $0.0万
    • 财政年份：
      1989
    • 负责人：
      田中 俊一
    • 依托单位：
      Tokyo University of Science
    光波利用センシング
    • 批准号：
      63102005
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Special Project Research
    • 资助金额：
      $5.57万
    • 财政年份：
      1988
    • 负责人：
      田中 俊一
    • 依托单位：
      Tokyo University of Science
    海外基金