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蛋白質のフォールディング中間体構造を用いた、フォールディング能に関する研究

利用蛋白质折叠中间结构研究折叠能力

基本信息

批准号：
08J00653
负责人：
田中俊一
金额：
$ 0.77万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、超好熱古細菌Thermococcus kodaraensis由来サチライシン(Tk-subtilisin)のフォールディング中間体構造の解析と、Foldability欠落因子の探索を行うことで"蛋白質のFoldabilityをもたらす重要な因子"の解明を目的とした。本年度ではその中間体構造の決定には至らなかったが、種々の部位特異的変異体を用いた生化学的解析および結晶構造解析により、"重要な因子の同定に成功した"。具体的には、プロペプチドと成熟体が相互作用する界面に注日し、その結合を欠損させるような変異体蛋白質を数種類構築した。これらの蛋白質を用いた解析から、相互作用界面に存在する成熟体側の酸性アミノ酸残基(グルタミン酸)をアラニンに置換した変異体蛋白質は、プロペプチドの補助によるフォールディング能を完全に失うことが明らかになった。一方で、他の変異体蛋白質に関しては、ある程度のフォールディング能の低下は見られるものの、完全に失うことは無かった。これらの解析結果から、相互作用界面に存在するグルタミン酸とプロペプチドとの結合がTk-subtihsinのFoldabilityをもたらす重要な因子であることを明らかにした。また、このグルタミン酸およびその側鎖が水素結合を形成するプロペプチド側の疎水性アミノ酸残基は、対象酵素のホモログ(サチライシンファミリー)に非常に良く保存されていることも明らかにした。このことから、本研究において明らかにした因子がサチライシン全般に普遍的に存在することを提唱した。以上の研究成果から、蛋白質のフォールディング能を決定付ける普遍的な因子について、新たな知見を得ることに成功した。

In this study, we studied the origin of Thermococcus kodaraensis, the origin of antifungal bacteria (Tk-subtilisin), the analysis of body formation and the analysis of Foldability deficiency factors. Protein, Foldability, protein, Foldability, protein, protein, protein This year, we have decided to use the analytical results of biochemical analysis and "important factors" to determine the success of the biochemistry analysis and the determination of important factors. Specific information on the interaction between mature bodies and mature bodies in the interface of interaction between mature bodies and mature bodies is very important. There are mature bodies, acid residues, acid residues (acid residues), somatic protein residues (acid residues, acid residues, acid residues, One side, the other side, the body protein, the body protein and the body protein. The results of the analysis of the results and the existence of the interaction interface show that there are significant factors in the interaction interface, such as Tk-subtihsin, Foldability, and so on. The combination of water and water is very important in the formation of acid residues, enzyme residues, enzyme residues, acid residues, enzyme residues, enzyme residues, acid residues, enzyme residues, enzyme residues, acid residues, acid residues, enzyme residues, enzyme residues, acid residues, acid residues, enzymes, enzymes, etc. The purpose of this study is to understand the general existence of the factor in this study. The above "research results", "protein", "protein" and "success" can determine the general factors and new insights into success.