Development of fundamental technology for accurate RNAomics

开发精确RNA组学的基础技术

• 批准号: 20360374
• 负责人: FUKUSAKI Eiichiro
• 金额: $ 11.56万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20360374/
• 关键词: メタボロミクス; LC; MS; RNA; miRNA; ゼブラフィッシュ; ナノLC; 質量分析; プローブ

Fundamental technology including separation and mass spectrometry for miRNA measurement have been studied. Micro flow meter based separation system was optimized. LC system was established through optimization of elutant, matrix, column etc. De novo sequencing of miRNA (longer than 20 base) was achieved by means of iontrap-time of flight mass spectrometry based MS(N) analysis. Ion mobility based mass spectrometry was also performed to separate sequence isomers. In addition, RNA analogous MS probe was created.

对miRNA的分离和质谱检测等基础技术进行了研究。对基于微流量计的分离系统进行了优化。通过对洗脱剂、基质、色谱柱等的优化，建立了高效液相色谱系统，并采用离子阱-飞行时间质谱（Iontrap-timeofflightmass spectrometry，MS（N））技术对20个碱基以上的miRNA进行了从头测序。还进行基于离子迁移率的质谱法以分离序列异构体。此外，还制备了RNA类似物MS探针。

项目成果

ポジティブモードCE-MSによるアニオン性代謝産物網羅的測定法とその応用

正模式CE-MS综合测定阴离子代谢物及其应用

• 发表时间: 2010
• 作者: 原田和生;福崎英一郎
• 通讯作者: 福崎英一郎

植物ホルモン類の網羅的高感度LC-ESI-MS/MS分析

植物激素的全面高灵敏度 LC-ESI-MS/MS 分析

• 发表时间: 2008
• 作者: 和泉 自泰;ら
• 通讯作者: ら

ナノフロー液体クロマトグラフィー/イオントラップ型質量分析計による植物ホルモン類の網羅的定量分析

使用纳流液相色谱/离子阱质谱对植物激素进行全面定量分析

• 发表时间: 2009
• 作者: 和泉自泰;岡澤敦司;馬場健史;小林昭雄;福崎英一郎
• 通讯作者: 福崎英一郎

DNA二重鎖中におけるアクリドニル基の塩基認識

DNA双链体中吖啶基的碱基识别

• 发表时间: 2009
• 作者: 桑原正靖;田島正義;尾崎広明
• 通讯作者: 尾崎広明

DNA鎖の主鎖修飾がポリメラーゼ反応に及ぼす影響

DNA链主链修饰对聚合酶反应的影响

• 发表时间: 2008
• 作者: 桑原正靖;竹島英俊
• 通讯作者: 竹島英俊