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Structural bases of spliceosome indepemdent splicing

Structural bases of spliceosome indepemdent splicing
剪接体独立剪接的结构基础
批准号：
20370038
负责人：
KOJIMA Chojiro
金额：
$13.15万
依托单位：
Nara Institute of Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2008
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2008 至 2010
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20370038/
关键词：
構造生物学NMRRNAタンパク質分子認識

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
研究了内质网应激反应中IRE1途径上剪接体独立剪接的结构基础。具体地说，酵母Ire1p的RNase结构域及其靶mRNAs被应用于结构和相互作用的研究。基于核磁共振数据，确定了RNase结构域和目标mRNAs的二级结构。许多突变体的切割实验和核磁共振滴定实验揭示了Ire1p的位点特异性核糖核酸酶反应机制。
英文摘要
Structural bases of spliceosome indepemdent splicing found on IRE1 pathway in ER stress response, are investigated. Specifically an RNase domain of yeast Ire1p and its target mRNAs are applied to structural and interaction study. Based on NMR data, secondary structures of the RNase domain and the target mRNAs are determined. Cleavage experiments and NMR titration experiments of many mutants have revealed the site-specific RNase reaction mechanism of Ire1p.
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会议论文
NMR analysis of Irelp induced HAC1 mRNA processing
Irelp 诱导的 HAC1 mRNA 加工的 NMR 分析
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [Kawahara, et al.]
通讯作者： et al.
A Novel Cold-Shock Vector Containing GST for Soluble NMR Sample Production
用于可溶 NMR 样品生产的新型冷激载体 GST
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [林こころ, 児嶋長次郎]
通讯作者： 児嶋長次郎
14-3-3 proteins act as intracellular receptors for rice Hd3a florigen
DOI： 10.1038/nature10272
发表时间： 2011-08-18
期刊： NATURE
影响因子： 64.8
作者： [Taoka, Ken-ichiro, Ohki, Izuru, Shimamoto, Ko]
通讯作者： Shimamoto, Ko
13Cメチル基をプローブとして用いるリジン側鎖を介した塩橋の解析法の開発
以 13C 甲基为探针开发赖氨酸侧链盐桥分析方法
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [服部良一, 大木出, 古板恭子, 池上貴久, 深田はるみ, 白川昌宏, 藤原敏道, 児嶋長次郎]
通讯作者： 児嶋長次郎
共 55 条
    Protein structure analysis in human cell using advanced in-cell NMR techniques
    • 批准号：
      20H03191
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.32万
    • 财政年份：
      2020
    • 负责人：
      KOJIMA Chojiro
    • 依托单位：
      Yokohama National University
    Development of fully-automated system for NMR structural analysis of higher molecular weight proteins
    • 批准号：
      17H03641
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.15万
    • 财政年份：
      2017
    • 负责人：
      KOJIMA Chojiro
    • 依托单位：
      Yokohama National University
    New NMR methods developed for structure determination of large proteins
    • 批准号：
      24657074
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.58万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      KOJIMA Chojiro
    • 依托单位：
      Osaka University
    NMR live imaging technology to monitor membrane protein structure
    • 批准号：
      23370053
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $12.81万
    • 财政年份：
      2011
    • 负责人：
      KOJIMA Chojiro
    • 依托单位：
      Osaka University
    国内基金
    海外基金
    基于NMR研究磷脂酰肌醇磷酸酶SHIP2自抑制作用的分子机制
    分子筛催化甲醇转化中活性位动态变化机制的固体NMR研究
    NMR研究尤文肉瘤相关融合基因EWS-FLI1 RNA的可变剪接调控机制
    基于细胞原位固体NMR的糖转运蛋白BjSemiSWEET动态转运机制研究
    • 批准号：
      22577099
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      50.00万元
    • 批准年份：
      2025
    • 负责人：
      谢华勇
    • 依托单位：
      武汉科技大学