Establishment and applications of a computational model for prediction of molecular recognition in aqueous solution by molecular orbital calculations

分子轨道计算预测水溶液分子识别计算模型的建立及应用

• 批准号: 20500276
• 负责人: TANI Seiji
• 金额: $ 1.75万
• 依托单位: Yamaguchi University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20500276/
• 关键词: 水和クラスター; 分子軌道計算; ギブズエネルギー; 水和構造; 電荷移動; 排除体積効果; 蛍光プローブ; ミトコンドリア; 自由エネルギー; 分子認識

In the present study, a computational model has been established for evaluating the thermodynamics of molecular recognition in aqueous solution by molecular orbital calculations. This computational model improves significantly the following issues : (i) the evaluation of the thermodynamic parameters of the solution structure of biomolecules and for molecular recognition processes and (ii) the analyses of the hydration structure in biomolecule-water clusters and their electronic structure.

本文通过分子轨道计算，建立了水溶液中分子识别热力学的计算模型。该计算模型显著地改进了以下问题：(I)生物分子溶液结构和分子识别过程的热力学参数的计算；(Ii)生物分子-水团簇的水化结构及其电子结构的分析。

项目成果

Proton NMR Studies on Rhodamine B in an Aqueous Clay Suspension

粘土水悬浮液中罗丹明 B 的质子 NMR 研究

• 发表时间: 2009
• 期刊: Clay Sci. 14
• 作者: S.Tani;H.Yamaki;D.Nakayama;Y.Suzuki;J.Kawamata
• 通讯作者: J.Kawamata

粘土との複合化により光分解が促進される有機色素の構造上の特徴

有机颜料与粘土复合时促进光降解的结构特征

• 发表时间: 2009
• 作者: 宮田大嗣;山田泰之;岩下伸也,;宮原弘臣;松崎秀文;古閑一憲;白谷正治;中山大輔
• 通讯作者: 中山大輔

プロトンNMRによる粘土水懸濁液中における有機色素の動的挙動と光分解

使用质子核磁共振研究粘土-水悬浮液中有机染料的动态行为和光降解

• 发表时间: 2009
• 作者: 谷誠治;山木博史;中山大輔;鈴木康孝;川俣純
• 通讯作者: 川俣純

量子化学計算による水和ペプチドの熱力学的安定性と電子構造の解析

使用量子化学计算分析水合肽的热力学稳定性和电子结构

• 发表时间: 2010
• 作者: Yoko Ishino;Takanori Harada;Misako Aida;谷誠治
• 通讯作者: 谷誠治

水和クラスターモデル計算による分子間相互作用の自由エネルギー解析:核酸塩基対

使用水合簇模型计算进行分子间相互作用的自由能分析：核酸碱基对

• 发表时间: 2008
• 作者: 山田訓;吉村昭彦;天野晃,信秋裕,嶋吉隆夫,陸健銀,シムエンボ,松田哲也;谷誠治
• 通讯作者: 谷誠治