Comparative evolutionary analysis on the olfactory and other chemosensory receptor gene families using whole genome sequences

使用全基因组序列对嗅觉和其他化学感应受体基因家族进行比较进化分析

• 批准号: 20770192
• 负责人: NIIMURA Yoshihito
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Tokyo Medical and Dental University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20770192/
• 关键词: 嗅覚受容体; 化学受容; 遺伝子ファミリー; 比較ゲノム; 分子進化; 脊椎動物; 霊長類; バイオインフォマティクス; 多重遺伝子族

Odor molecules in the environment are detected by olfactory receptors (ORs). Reflecting the diversity of odorants, vertebrate genomes harbor numerous OR genes. In this study, I have examined the relationships between degeneration of olfactory ability (decrease in the number of OR genes) and development of color vision (acquisition of trichromatic vision). As a result, contrary to the previous view, I showed that there are no direct links between them. Moreover, I investigated genome sequences from diverse organisms including amphioxus, which is a basal chordate species (relatives of vertebrates). I then revealed the origin and the early evolution of OR gene families.

环境中的气味分子由嗅觉受体（ORs）检测。脊椎动物基因组中含有大量的OR基因，反映了气味的多样性。在这项研究中，我检查了嗅觉能力退化（OR基因数量减少）和色觉发育（获得三色视觉）之间的关系。因此，与以前的观点相反，我表明它们之间没有直接联系。此外，我还研究了包括文昌鱼在内的多种生物的基因组序列，文昌鱼是一种基底脊索动物（脊椎动物的亲戚）。然后我揭示了OR基因家族的起源和早期进化。

项目成果

嗅覚受容体遺伝子ファミリーの進化ダイナミクス-ゲノムと環境の相互作用-

嗅觉受体基因家族的进化动力学-基因组-环境相互作用-

• 发表时间: 2009
• 期刊: 実験医学 (12月号)27
• 作者: Yoshitake Ohashi;Nobuyuki Takatani;Makiko Aichi;Shin-ichi Maeda;Satoru Watanabe;Hirofumi Yoshikawa;Tatsuo Omata.;Yoshihito Niimura
• 通讯作者: Yoshihito Niimura

脊椎動物嗅覚受容体遺伝子ファミリーの進化-環境に応じて変化するゲノム-

脊椎动物嗅觉受体基因家族的进化-响应环境而变化的基因组-

• 发表时间: 2010
• 作者: 愛知真木子;市橋泰範;南基泰;Yoshihito Niimura;Yoshihito Niimura;新村芳人
• 通讯作者: 新村芳人

Diversity of Olfactory Receptor Gene Repertoires among 38 Mammals

38 种哺乳动物嗅觉受体基因库的多样性

• 发表时间: 2011
• 作者: Niimura Y;Matsui A
• 通讯作者: Matsui A

Diversity of preferred nucleotide sequences around the translation initiation codon in eukaryote genomes.

• DOI: 10.1093/nar/gkm1102
• 发表时间: 2008-02
• 期刊: Nucleic acids research
• 影响因子: 14.9
• 作者: Nakagawa S;Niimura Y;Gojobori T;Tanaka H;Miura K
• 通讯作者: Miura K

化学受容の科学(「嗅覚受容体遺伝子ファミリー」)

化学感受科学（“嗅觉受体基因家族”）

• 发表时间: 2011
• 作者: Nakagawa S;Niimura Y;Gojobori T;Tanaka H;Miura K;Yoshihito Niimura;新村芳人;新村芳人
• 通讯作者: 新村芳人