リソソーム病の網羅的変異体立体構造データベースの構築

溶酶体疾病变异综合三维结构数据库的构建

• 批准号: 20659166
• 负责人: 櫻庭 均
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: Meiji Pharmaceutical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20659166/
• 关键词: リソソーム病; 立体構造; データベース; ファブリー病; ポンペ病; GM1ガングリオシドーシス; モルキオB病; ムコ多糖症I型; テイーサックス病

一群のリソソーム病の原因となる疾患遺伝子変異により、その発現蛋白質の立体構造にどんな変化が起こり、それが分子病態や臨床表現型にどんな影響を与えるかについて解析した。そして、その解析により得られた情報をリソソーム病の診断や治療に役立てるためのデータベースを構築することを目的に研究を行った。昨年度に行ったファブリー病、テイ-サックス病およびムコ多糖症I型における疾患関連酵素の立体構造解析に引き続き、今年度は、ポンペ病(酸性α-グルコシダーゼ欠損症)とGM1ガングリオシドーシスおよびモルキオB病(B-ガラクトシダーゼ欠損症)の疾患関連酵素について、まず野性型酵素の立体構造モデルをin silicoで構築した後に、病因となるアミノ酸置換による立体構造変化の領域と強さとを推定した。また、発生頻度が高く、酵素補充治療が可能であるため臨床的重要性が高いファブリー病に対しては、α-ガラクトシダーゼの立体構造変化の解析データから、病患の臨床表現型を推定するための方法を開発した。本法は、root meandeviation, the differences in hydropathy between the wild type and mutantやthe size of an amino acid in the mutantなどの計算値を基に、フローチャートに従って行うもので、その正確度は86%であった。さらに、これまで報告されたファブリー病の病因遺伝子変異の種類、臨床表現型や文献の他、α-ガラクトシダーゼの立体構造変化について詳細に知ることが出来るデータベースを作成して、これを公開した(http://www.fabry-database/org/)。これらの情報は、ファブリー病の病態を理解し、適切な治療法を策定するために有用であると期待される。

The cause of a group of diseases, the disease remains, the three-dimensional structure of the protein, and the three-dimensional structure of the protein.な変化が开こり、それがmolecule pathologyや clinical manifestationsにどんなimpactを和えるかについてanalyticsした. The analysis of the disease and the diagnosis and treatment The purpose of the establishment of the building is to study and conduct research. Last year's disease, polysaccharidosis type I, polysaccharidosis, and polysaccharidosis Suffering from three-dimensional structure analysis of related enzymes, this year's disease, and Nono's disease (acid α-グルコシダーゼ deficit disease) and GM1ガングリオシドーシスおよびモルキオB disease (B-ガラクトシダーゼdeficiency disease) disease-related enzyme について, まず wild-type enzyme のthree-dimensional structure モデルをin The cause of the disease is the acid replacement of the three-dimensional structure and the field of silico construction and the presumed cause.また、The frequency of rashes is high が、Enzyme supplementation treatment is not possible であるためThe clinical importance is high いファブリー disease に対しては、α- The analysis of the three-dimensional structural changes of the patient's clinical phenotype and the method of estimating the patient's clinical phenotype are also carried out.本法は、root meandeviation, the differences in hydropathy between the wild type and mutantやthe size of an amino acid in the Mutantなどのcalculates the value of the base, the accuracy of the calculation, and the correctness of the mutant is 86%. The disease is reported to have different causes and causes. Clinical manifestations of the literature, α-ガラクトシダーゼのthree-dimensional structure change of the α-ガラクトシダーゼのDetailed information is available on the website and published on the website (http://www.fabry-database/org/).これらのinformationは、ファブリー DiseaseのmorbidityをUnderstandingし、Appropriate treatment methodをdeterminationするためにUseful and expectingされる.

项目成果

ファブリー病:分子病態の解明から診断と治療へ

法布里病：从分子病理学阐明到诊断和治疗

• 发表时间: 2009
• 作者: Sugawara K.;et al.;櫻庭均
• 通讯作者: 櫻庭均

Structural characterization of mutant a-galactosidases causing Fabry disease.

引起法布里病的突变α-半乳糖苷酶的结构特征。

• 发表时间: 2008
• 期刊: J. Hum. Genet. 53
• 作者: Sugawara K.;et al.
• 通讯作者: et al.

ティーサックス病 : ヘキソサミニダーゼAにおける構造変化と臨床表現型との関連性.

茶萨病：己糖胺酶 A 的结构变化及其与临床表型的关联。

• 发表时间: 2008
• 作者: Sugawara K.;et al.;櫻庭均;櫻庭 均
• 通讯作者: 櫻庭 均

Structural basis of GM1 gangliosidosis and Morquio B disease

GM1 神经节苷脂沉积症和 Morquio B 病的结构基础

• 发表时间: 2009
• 期刊: J.Hum.Genet. 54
• 作者: Morita M;et al.
• 通讯作者: et al.

Structural modeling of mutant α-glucosidases resulting in a processing/transport defect in Pompe disease.

导致庞贝病加工/运输缺陷的突变α-葡萄糖苷酶的结构模型。

• 发表时间: 2009
• 期刊: J. Hum. Genet., Doi:10.1038/jhg.
• 作者: Sugawara K.;Saito S.;Sekijima M.;Ohno K.;Tajima Y.;Kroos M.A.;Reuser A.J.J.;Sakuraba H.
• 通讯作者: Sakuraba H.