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生体分子モーターの一分子非平衡統計力学

生体分子モーターの一分子非平衡統計力学
生物分子马达的单分子非平衡统计力学
批准号:
20740239
负责人:
原田 崇広
金额:
$2.83万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2009

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项目成果

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昨年度までに、我々の得た揺らぎと応答およびエネルギー散逸量との関係式が、コロイド分散系の密度場のように、力学的自由度以外にも適用できることを明らかにした。これをさらに一般化して、粒子間の流体力学的相互作用を考慮し、流体場についても揺らぎと応答の関係を議論し、エネルギー散逸量に関する関係式を導くこと第一の目標として、考察を進めてきた。これが可能となれば、実際の分子モーターを形作るタンパク質と流体との相互作用や溶媒効果を取り入れることが可能となり、さらに広範な物理系・生体分子系にも適用範囲を広げることが期待される。第二の目的として、これまでは、エネルギー散逸量の平均値しか議論していなかった理論を、散逸の揺らぎの高次モーメントの情報を取り込むことによって、理論の形式をより一般化することを目指して研究を行った。これら2つの目標のうち、特に第一の目的に対しては、微小粒子やタンパク質の単純液体中の運動は、低レイノルズ数の流体力学現象であり、Stokes方程式で記述でき、流体系が線形で時間を含まないことからエネルギー散逸に関しては、散逸関数で変分原理的に書き表すことが可能であり、粒子の運動を記述するダイナミクスと併せても統一的な力学表現が可能となる。この考察を進めていくことにより、一般化の可能性が広がるという一定の見通しがえられるなど、一定の進歩を得ることが出来た。
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会议论文
分子機械系におけるゆらぎと応答のエネルギー論
分子机械系统中波动和响应的能量学
DOI: --
发表时间: 2009
期刊: 生物物理 Vol.49(2009)
影响因子: --
作者: [Ryota Negishi, Yasuhide Ohno, Kenzo Maehashi, Kazuhiko Matsumoto, Yoshihiro Kobayashi, 原田崇広]
通讯作者: 原田崇広
Energetics of fluctuations and response in nonequilibrium Langevin systems
非平衡朗之万系统中的波动和响应的能量学
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [土山典子, 原田崇広, 根岸良太, 水島健, 原田崇広, T. Harada]
通讯作者: T. Harada
分子モーターの軌道の効率的なベイズ推定法
分子运动轨迹的高效贝叶斯估计方法
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [宮崎牧人, 原田崇広]
通讯作者: 原田崇広
微小な非平衡系の揺らぎと応答のエネルギー論
微小非平衡系统的涨落能量和响应
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [土山典子, 原田崇広, 根岸良太, 水島健, 原田崇広]
通讯作者: 原田崇広
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    興奮性細胞の揺らぎのダイナミクス-単一細胞解析によるアプローチ
    • 批准号:
      19031010
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $5.57万
    • 财政年份:
      2007
    • 负责人:
      原田 崇広
    • 依托单位:
    培養心筋組織における自発的パターン形成と拍動のダイナミクス
    • 批准号:
      18840021
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
    • 资助金额:
      $1.83万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      原田 崇広
    • 依托单位:
    培養心筋細胞系における拍動パターンの時空間ダイナミクスとその生物学的意義
    • 批准号:
      03J05494
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $2.11万
    • 财政年份:
      2003
    • 负责人:
      原田 崇広
    • 依托单位:
    海外基金