Functional analysis of cis-and trans-acting factors to govern chromatin dynamisms in transcriptional regulation

转录调控中控制染色质动态的顺式和反式作用因子的功能分析

• 批准号: 21570185
• 负责人: SHIMIZU Mitsuhiro
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Meisei University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21570185/
• 关键词: 遺伝子; 発現制御; ゲノム; クロマチン; ヌクレオソーム; 転写制御; DNA構造; ヒストン; 出芽酵母; 酵母

Mechanisms of nucleosome positioning and its dynamics are one of the central issues to understand gene expression in eukaryotes. In this study, we identified several DNA repeat sequences acting as cis-elements for nucleosome formation and transcriptional regulation in the yeast cells. Also, we investigated the roles of the chromatin remodeling Isw2 complex, the histone deacetylase Rpd3 and histone H3 variants as trans-acting factors fbr nucleosome positioning as well as transcription.

核小体的定位机制及其动力学是了解真核生物基因表达的核心问题之一。在这项研究中，我们确定了几个DNA重复序列作为顺式元件的核小体形成和转录调控的酵母细胞。此外，我们研究了染色质重塑Isw 2复合物，组蛋白脱乙酰基酶Rpd3和组蛋白H3变体作为反式作用因子fbr核小体定位以及转录的作用。

项目成果

The effect of human telomeric sequences on nucleosome positioning in yeast cells

人类端粒序列对酵母细胞核小体定位的影响

• 发表时间: 2011
• 作者: Y.Ichikawa;N.Morohashi;Y.Nishimura;H.Kurumizaka;M.Shimizu
• 通讯作者: M.Shimizu

酵母ゲノムでのシスおよびトランス因子の変異によるヌクレオソームの機能解析

酵母基因组中顺式和反式因子突变对核小体的功能分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 小野哲也;上原芳彦;小村潤一郎;清水光弘
• 通讯作者: 清水光弘

クロマチン関連転写因子Ume6における天然変性領域の機能解析

染色质相关转录因子 Ume6 自然退化区域的功能分析

• 发表时间: 2012
• 作者: Komura J;Ikehata H;Mori T;Ono T;清水光弘
• 通讯作者: 清水光弘

DNAリピート配列のクロマチン構造とその転写制御に及ぼす影響

DNA重复序列对染色质结构和转录调控的影响

• 发表时间: 2011
• 作者: Tanaka;K.;Tanaka K;清水光弘
• 通讯作者: 清水光弘

Highly Efficient Chromatin Transcription Induced by Superhelically Curved DNA Segmens : The Underlying Mechanism Revealed by a Yeast System

超螺旋弯曲 DNA 片段诱导的高效染色质转录：酵母系统揭示的潜在机制

• 发表时间: 2010
• 期刊: Biochemistry
• 影响因子: 2.9
• 作者: Jun-ichi Tanase;Nobuyuki Morohashi;Masashi Fujita;Jun-ichi Nishikawa;Mitsuhiro Shimizu;Takashi Ohyama
• 通讯作者: Takashi Ohyama