ゲノム情報を利用した放線菌における非翻訳型RNAによる遺伝子制御機構の解析

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本研究では、基礎生物学的にも工業的にも極めて重要な菌群である放線菌における非翻訳型RNAによる遺伝子発現制御機構の全容解明を最終目標としている。放線菌の遺伝子発現シグナルネットワークに関する知見を拡大することは、抗生物質や免疫抑制剤をはじめとする多種多様な二次代謝産物生産の観点から、医学や工業といった実用に多大な貢献をもたらすものである。本年度は、放線菌Streptomyces griseusにおいて既に研究代表者が同定していた12種の非翻訳型RNAについての情報をもとに、その機能解析およびRNA結合タンパク質の探索を前年度より継続して行った。その結果、同定した非翻訳型RNAのうち1つがS.griseusの形態分化を正に制御する因子であることが示唆された。放線菌の形態分化に関与する非翻訳型RNAについての報告は過去になく、本RNAは新規性の高い因子である可能性が高いと予想され、その詳細な機能解析を進めている。また、RNA結合タンパク質の候補として、あるタンパク質に注目して解析を行ったところ、RNA結合能は見られなかったものの非特異的DNA結合能およびRNase活性を持つことが明らかになり、さらにそれらの活性に重要な残基を同定した。本タンパク質は既知RNaseとは全く配列相同性を示さないにも関わらずRNase活性を示したことから、新規なファミリーのRNaseであると予想され、さらなる解析を進めている。