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グラム陽性細菌における非翻訳型RNAによる転写制御機構の解析

革兰氏阳性菌非翻译RNA转录调控机制分析

基本信息

批准号：
15030202
负责人：
中村幸治
金额：
$ 4.1万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

ゲノム上には、蛋白質をコードする遺伝子の他に、転写はされるが蛋白質をコードせず、RNAそのものとして機能する非翻訳型RNAが多く存在し、生命現象の重要な機能を有している。リボソームRNAやtRNA、あるいは、真核生物のスプライシング過程において働くsnRNA(核内小RNA)は、機能が十分に明らかにされた非翻訳型RNAであるが、様々な生物種において、ゲノム解析が進むにつれ、これまでの予想を超える数の非翻訳型RNAが存在することが明らかとなってきた。大腸菌においても、30種類の非翻訳型RNAが同定されているが、これらの多くは菌の生育に必ずしも必須ではなく、外部環境の変化に対応するための応答反応を主に制御している。BS190 RNAは、枯草菌において同定された安定かつ、大量に存在する非翻訳型RNAである。本研究では、遺伝子破壊株を用いた解析を行い、機能解析を行った。DNAマイクロアレイ解析の結果、BS190 RNA遺伝子破壊株では、6個の遺伝子の発現が野生型と比べ、20倍以上に上昇していた。これらの遺伝子はすべて同一のオペロン上に存在し、分岐状の側鎖を持つアミノ酸(Ile,および、Val, Leu)の生合成に関与している。さらに、BS190 RNAは、このオペロンのプロモーター下流のリーダー配列と10塩基の相補配列を2ヶ所持ち、ゲルシフト解析の結果、mRNAのリーダー配列と相互作用することが明らかとなった。以上の結果より、BS190RNAは、5'リーダー配列と相互作用することにより、転写レベルで負に発現制御することが示唆された。これまで、非翻訳型RNAの機能については、翻訳レベルでの報告に限られており、転写レベルでの機能を示した最初の報告として、本研究は意義深い。また、同時に進行しているほかの非翻訳型RNAの解析からも、アミノ酸や2次代謝産物の生合成に関与する非翻訳型RNAが存在していた。

On the computer, protein, protein, The RNA tRNA, eukaryote, eukaryote, eukaryote, Major bacteria, 30-year-old non-retrograde RNA are the same as those of the same type of bacteria, and the fertility of bacteria must be affected, and the external environment must be affected. BS190 RNA and Bacillus subtilis were identified as diazepam, and there were a large number of non-inverted RNA fragments. In this study, the broken strains were analyzed by the computer and the machine. The results of DNA test were analyzed, the strains of BS190 RNA were broken, and the wild type strains were found in 6 strains, and more than 20 times higher. In the same situation, there are bifurcations and bifurcations of acid (Ile, acid, Val, Leu) that are synthesized and synthesized. The results of the analysis of the data held by the column 2, the results of the analysis, the interaction of the mRNA, the interaction, the interaction between the two, the results of the analysis, the interaction, the interaction. The above results show that the interaction between each other, the BS190RNA, the 5 'radar, the interaction, the control, the interaction, the The non-flip RNA machine can compare the report, read the report and write the report to show that the report is not valid at first. At the same time, there are significant differences in the analysis of non-inverted RNA, the synthesis of secondary substitutes and the presence of non-reversing RNA.