使用枯草芽孢杆菌非翻译 RNA 进行基因表达控制网络分析-猫眼课题宝

使用枯草芽孢杆菌非翻译 RNA 进行基因表达控制网络分析

批准号：

15013205

负责人：

中村幸治

金额：

$4.16万

依托单位：

University of Tsukuba

依托单位国家：

日本

项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

财政年份：

2003

资助国家：

日本

项目状态：

已结题

起止时间：

2003 至 --

来源：

https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15013205/

关键词：

枯草菌遺伝子間領域非翻訳型RNA リボ制御リボスイッチマイクロアレイ解析ポストゲノム解析アテニュエーター

项目摘要

项目成果

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ゲノム解析により、多くのギャップ領域が存在することが明らかにされてきた。ギャップ領域は、非常に小さな分子量のタンパク質をコードする場合もあるが、多くは翻訳されない非翻訳型RNAをコードする。ゲノム上の全遺伝子情報を解析し、機能面でのネットワークを解明する上で、非翻訳型RNAの機能解析は重要である。枯草菌の対数増殖期の菌体の全RNA中に10種類程度の低分子RNAの存在を確認した。ノーザン解析から、このうち、4種類は5S RNA、scRNA、tmRNA、M1 RNAであった。長さが200塩基付近の2本のバンドについて(BS190RNA、および、BS200RNA)、ゲル抽出後、3'末端へpoly(A)付加して作成したcDNAの塩基配列を決定した。、その結果、spS-yrvM遺伝子間のギャップ領域にコードされていた。両末端の解析から、BS200RNAから、5'末端の10塩基が切断され、BS190RNAとなることが示唆された。BS190RNA遺伝子の欠損変異株では、増殖能の低下が見られ、タンパク質合成も一部阻害されていた。一方、X6Hisタグを付加したRNAポリメラーゼβサブユニットを発現する枯草菌から調製した菌体抽出液に対して、Ni-NTAカラムを用いてプルダウン実験を行った結果、BS190RNAは、特異的に、RNAポリメラーゼのホロ酵素と結合することが明らかとなった。また、枯草菌で新たに見いだした10種類の非翻訳型RNAの破壊株を用いたマイクロアレイ解析より、5種類の非翻訳型RNAは、他の遺伝子を転写レベルで制御していた。また、100塩基以下の領域の解析により、3種類のリボスイッチ領域を同定して、解析を行った。

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会议论文

Kumano, M., Nakamura, K.他: "Licomycin resistance mutations in two regions immediately downstream of the -10 region of lmr promoter cause overexpression of a putative multidrug efflux pump in Bacillus subtilis mutants."Antimicrob.Agents Chemother.. 47・1. 4

Kumano, M., Nakamura, K. 等人：“紧邻 lmr 启动子 -10 区域下游的两个区域中的利可霉素抗性突变导致枯草芽孢杆菌突变体中推定的多药外排泵的过度表达。”Antimicrob.Agents Chemother.. 47. 14

DOI： --

发表时间：

期刊：

影响因子： --

作者：

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