Study on the control of gene expression network in Streptomyces growing in the soil environment

土壤环境中链霉菌基因表达网络调控研究

• 批准号: 21380050
• 负责人: FUJII Takeshi
• 金额: $ 9.57万
• 依托单位: National Institute for Agro-Environmental Sciences
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21380050/
• 关键词: 土壌生物; 遺伝子発現; マイクロアレイ解析; 放線菌; キチナーゼ; 土壌環境; 抗生物質生産; キチン; 遺伝子発現制御; 細菌; マイクロアレイ; 酵素; 抗生物質; 発現制御

To provide new insights into the cellular response to nutrients and regulation cascade of antibiotic production genes in global gene expression of Streptomyces in soil, genome-wide transcriptional analysis with microarray technology was performed using RNA extracted from the wild type and mutant strains of Streptomyces coelicolor grown in soil cultures. Microarray analyses revealed that expression of genes for secondary metabolism was induced by chitin together with primary metabolic genes in soil cultures of Streptomyces coelicolor. The data also indicated that a transcriptional factor, DasR, was involved in the regulation of gene expression for chitin catabolism, secondary metabolism and stress responses.

为了研究土壤中链霉菌对营养物质的响应和抗生素产生基因的调控级联反应，利用微阵列技术对天蓝色链霉菌野生型和突变株的RNA进行了全基因组转录分析。基因芯片分析表明，次级代谢基因的表达诱导几丁质与初级代谢基因在天蓝色链霉菌土壤培养。这些数据还表明，一个转录因子，DasR，参与调控基因表达的几丁质催化剂，次生代谢和胁迫反应。

项目成果

A novel method for RNA extraction from Andosols using casein and its application to amoA gene expression study in soil

• DOI: 10.1007/s00253-012-4342-3
• 发表时间: 2012-08
• 期刊: Applied Microbiology and Biotechnology
• 影响因子: 5
• 作者: Yong Wang;K. Nagaoka;M. Hayatsu;Yoriko Sakai;Kanako Tago;S. Asakawa;T. Fujii

Evaluation of Methods of Determining Humic Acids in Nucleic Acid Samples for Molecular Biological Analysis

• DOI: 10.1271/bbb.100597
• 发表时间: 2011-02
• 期刊: Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
• 作者: Yong Wang;T. Fujii

放線菌Streptomyces coelicolor A3(2)のDasDタンパク質は細胞内局在型β-N-アセチルグルコサミニダーゼとして機能する

天蓝色链霉菌 A3(2) 的 DasD 蛋白作为细胞内定位的 β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶发挥作用

• 发表时间: 2011
• 作者: 折原由香里;海老瀬広規;村上聡史;齋藤明広;安藤昭一;藤井毅;宮下清貴
• 通讯作者: 宮下清貴

スギ落葉から分離したPestalotiopsis sp.属糸状菌が生産するカテコール配糖化酵素の精製と諸性質.食と緑の科学.65:75-80

从日本雪松落叶中分离出的多盘拟盘丝状真菌产生的儿茶酚糖基转移酶的纯化和特性 食品与绿色科学 65：75-80

• 发表时间: 2011
• 期刊: 食と緑の科学
• 作者: 齋藤政則;篠山浩文;齋藤明広;知久和寛;安藤昭一
• 通讯作者: 安藤昭一

N-アセチル-β-D-グルコサミニダーゼDasDの放線菌Streptomyces coelicolor A3(2)における機能の解析

天蓝色链霉菌A3(2)中N-乙酰基-β-D-氨基葡萄糖苷酶DasD的功能分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 齋藤明広;村上聡史;海老瀬広規;杉山裕多;安藤昭一;藤井毅;宮下清貴
• 通讯作者: 宮下清貴