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Preferences of synonymous codons and translational control during the chloroplast genome evolution
叶绿体基因组进化过程中同义密码子的偏好和翻译控制
基本信息
- 批准号：21770258
- 负责人：
- 金额：$ 2.66万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份：2009
- 资助国家：日本
- 起止时间：2009 至 2010
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
In chloroplasts, the translation efficiencies of synonymous codons are not always correlated with their codon usage. Tobacco chloroplast rps2 mRNA contains many codons having efficient translation activity, whereas rps16 mRNA has a lot of inefficient codons. To elucidate whether the codon preference affect the translation efficiencies of these mRNAs, I analyzed the translation efficiencies of rps2 and rps16 mRNAs using the in vitro translation system from tobacco chloroplasts. I found that (1) 5'UTR of rps16 mRNA has less translation activity, (2) protein coding region of rps16 mRNA was translated about 3-times faster than that of rps2 mRNA, and (3) codon substitutions increased that translation efficiency of protein coding region of rps16 mRNA.
在叶绿体中，同义密码子的翻译效率并不总是与它们的密码子使用相关。烟草叶绿体rps 2 mRNA含有许多具有高效翻译活性的密码子，而rps 16 mRNA含有许多无效密码子。为了阐明密码子偏好是否影响这些mRNA的翻译效率，我使用烟草叶绿体的体外翻译系统分析了rps 2和rps 16 mRNA的翻译效率。结果发现：（1）rps 16 mRNA的5 '非翻译区翻译活性较低;（2）rps 16 mRNA的蛋白质编码区翻译速度比rps 2 mRNA快3倍;（3）密码子替换提高了rps 16 mRNA蛋白质编码区的翻译效率。
项目成果
期刊论文数量（0）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Correlation between codon usage and translation efficiencies of synonymous codons in tobacco chloroplasts
烟草叶绿体中同义密码子的密码子使用与翻译效率之间的相关性
- DOI：
- 发表时间：2009
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Nakamura;M.;Sugiura;M.
- 通讯作者：M.
植物核に挿入されたコード領域はヌクレオソームと転写単位の再編成を引き起こす
插入植物核的编码区域导致核小体和转录单位的重排
- DOI：
- 发表时间：2010
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：工藤久幸;松尾充啓;木村宏;中邨真之;山本義治;小保方潤一
- 通讯作者：小保方潤一
タバコ葉緑体rps2 mRNAとrps16 mRNAの翻訳効率の比較
烟草叶绿体rps2 mRNA和rps16 mRNA翻译效率比较
- DOI：
- 发表时间：2009
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：中邨真之;杉浦昌弘
- 通讯作者：杉浦昌弘
クリプティックプロモーターの活性化メカニズムと転写領域の新生
隐性启动子的激活机制与新一代转录区
- DOI：
- 发表时间：2010
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：小保方潤一;工藤久幸;松尾充啓;佐藤壮一郎;中邨真之;山本義治;木村宏
- 通讯作者：木村宏
Comparative analysis of the translation efficiencies between rps2 and rps16 mRNAs in tobacco chloroplasts
烟草叶绿体中rps2和rps16 mRNA翻译效率的比较分析
- DOI：
- 发表时间：2010
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Nakamura;M.;Sugiura;M.
- 通讯作者：M.
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