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カイメン襟細胞トランスクリプトームに多細胞動物の起源と幹細胞の起源をさぐる

研究海绵领细胞转录组中多细胞动物和干细胞的起源

基本信息

批准号：
10F00397
负责人：
船山典子
金额：
$ 1.34万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2012
项目状态：
已结题

项目摘要

H23年度に引き続きカワカイメンの芽球からの個体形成個体を用い、23年度に確立したFACSとラベリングの組み合わせにより、アーキオサイト(幹細胞)画分、襟細胞画分、その他の細胞の混合画分を分収、RNAを抽出した。SMARTer^<TM>UltraLowRNAKitfor Illumina^<○!R> Sequencingに用いられる質も良いRNAを得られたと判断出来、illuminaシークエンサーでの塩基配列決定を外注、7月にデータを得た。アセンブル(referenceとして、当研究室のESTライブラリーの配列、OISTの佐藤矩行研究室に配列決定していただいた454配列データを用いた)、アノテーションを行った。特に難しかったのは、3つの細胞画分において、発現量がどの程度差があれば「差がある」とするかという点である。様々な検討とこれまでの論文を参考にしてディスカッションを重ね、2倍以上の差を有意とした。現在、定量的な解析はさらに検討中であり、結果はまだプレリミナリーではあるが、アーキオサイトでは、DNA修復、テロメアーゼ活性、分裂中におけるゲノムの保護などに関与すると報告されている遺伝子を多く発現していると示唆されている(Figure4.B)。これは芽球からの個体形成過程において、アーキオサイトは非常に活発に分裂、自己複製と分化を行っている事実、特に自己複製の際には、幹細胞としてゲノムの保護が必要と考えられることと一致する。さらなる解析が必要であるが、、アーキオサイトにおいて、他の動物で生殖系の細胞で特異的な発現のある遺伝子について高い発現が示されたことは、これまでの当研究グループのWISHによる解析(unpublished data)と一致する傾向である。ただし、WISHによる解析と一致しない、例えばWISHでは明瞭にアーキオサイトと襟細胞の両方で特異的な発現が見られるものの、本研究では一方での発現しか見られないという例も複数あり、本研究の解析をより詰めた後に、WISHと細胞分収の個体形成過程の違いを考慮し、より深くアーキオサイトと襟細胞の分子基盤を解析・解明する手がかりとしたい。

In 2013, the development of individual cells was introduced, and in 2013, the development of individual cells was established. In 2013, the development of individual cells was established. In 2013, the development of stem cells was analyzed. In 2013, FACS was used to extract RNA. SMARTer^<TM>UltraLowRNAKitfor Illumina^<○! R> Sequencing is used to determine the quality of the RNA, illumination is used to determine the base alignment, and July is used to determine the base alignment. In the case of the case of Special difficulties, 3 cell points, the degree of difference, the difference, the difference. The difference of more than 2 times is intentional. Now, quantitative analysis of the results in the study, the results of the study, the loss of information, DNA repair, loss of activity, division in the study, the need to protect the relationship between the report and the middle of the gene more appear in the study (Figure4.B). The process of individual formation of stem cells is very active, division, self-replication and differentiation are very important, and the protection of stem cells is necessary. This analysis is necessary to determine whether there is a tendency for unpublished data analysis to be consistent with the unpublished data analysis of the germ line cells of other animals. The analysis of WISH is consistent with that of WISH. For example, WISH is not clear about the occurrence of specific cells. In this study, we consider the occurrence of one side of WISH. The analysis of molecular substrates of cells in deep space