臨床システム生物学を用いた循環器疾患の解析
臨床システム生物学を用いた循環器疾患の解析
批准号:
10F00801
负责人:
五斗 進
金额:
$1.41万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2010
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2010 至 2012
中文摘要
動脈硬化などに代表される循環器疾患では、その発症メカニズムの解明と治療法の確立が大きな課題となっている。本研究では、循環器疾患の発症メカニズムを解明するための、複数オミックスデータ解析法を開発することを目的とする。平成24年度は、平成23年度までに設計したワークフローをマウスモデルに適用した結果を詳細に解析し、食事中のコレステロールと高コレステロール血症薬であるロスバスタチンなどの投与が肝臓に影響を与える際の主な代謝物としてジグリセリドを同定した。更に高コレステロール食を与えたマウスの解析からもジグリセリドがアテロームの発生に関連する代謝産物であることが明らかになり、肝臓の慢性炎症に関与していることが示唆された。特に、O2PLSに基づくSUS2プロット解析によってロバスタチンが高コレステロール食を与えたマウスのジグリセリドプロファイルをコントロールのマウスと同じプロファイルに戻すことが分かった。これらの結果をまとめた論文は、Analytical Chemistry誌に採録された。O2PLSを用いたワークフローの別の応用として、環境ホルモン(17βエストラジオール)を投与した魚(黒鯛)の血中メタボロームのプロファイル解析にも応用した。その際に、実験間の共通性と特性をより解釈しやすくするための拡張も試みた。その結果、トリメチルアミンオキサイド(TMAO)とコリンが環境ホルモンに影響を受けた魚のバイオマーカーとして有望であることが明らかになった。さらに、別の応用として、生分解性プラスチックの熱可塑性の最適化にも適用した。
英文摘要
動脈硬化などに代表される循環器疾患では、その発症メカニズムの解明と治療法の確立が大きな課題となっている。本研究では、循環器疾患の発症メカニズムを解明するための、複数オミックスデータ解析法を開発することを目的とする。平成24年度は、平成23年度までに設計したワークフローをマウスモデルに適用した結果を詳細に解析し、食事中のコレステロールと高コレステロール血症薬であるロスバスタチンなどの投与が肝臓に影響を与える際の主な代謝物としてジグリセリドを同定した。更に高コレステロール食を与えたマウスの解析からもジグリセリドがアテロームの発生に関連する代謝産物であることが明らかになり、肝臓の慢性炎症に関与していることが示唆された。特に、O2PLSに基づくSUS2プロット解析によってロバスタチンが高コレステロール食を与えたマウスのジグリセリドプロファイルをコントロールのマウスと同じプロファイルに戻すことが分かった。これらの結果をまとめた論文は、Analytical Chemistry誌に採録された。O2PLSを用いたワークフローの別の応用として、環境ホルモン(17βエストラジオール)を投与した魚(黒鯛)の血中メタボロームのプロファイル解析にも応用した。その際に、実験間の共通性と特性をより解釈しやすくするための拡張も試みた。その結果、トリメチルアミンオキサイド(TMAO)とコリンが環境ホルモンに影響を受けた魚のバイオマーカーとして有望であることが明らかになった。さらに、別の応用として、生分解性プラスチックの熱可塑性の最適化にも適用した。
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专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Systems biology approaches for investigating the relationship between lipids and cardiovascular diseases
研究脂质与心血管疾病之间关系的系统生物学方法
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
Current Cardiovascular Risk Report
影响因子:
--
作者:
[Kirwan, G.M., Diez, D., Haeggstrom, J.Z., Goto, S., Wheelock, C.M.]
通讯作者:
C.M.
DOI:
10.1021/ac301269r
发表时间:
2012-08-21
期刊:
ANALYTICAL CHEMISTRY
影响因子:
7.4
作者:
[Kirwan, Gemma M., Johansson, Erik, Wheelock, Craig E.]
通讯作者:
Wheelock, Craig E.
Integration of large scale omic's datasets using 02PLS
使用 02PLS 集成大规模 omic 数据集
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kirwan GM, Johansson E, Goto S, Kooistra T, Kleemann R, Wheelock AM, Wheelock CE]
通讯作者:
Wheelock CE
病原体が持つ抗原変異多コピー遺伝子ファミリーのメタゲノム解析
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批准号:10F00786
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2010
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负责人:五斗 進
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依托单位:
遺伝子発現情報を用いたマラリアの病原性に関する研究
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批准号:07F07418
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2007
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负责人:五斗 進
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依托单位:
マラリア原虫Plasmodium falciarumの疾病立過程に関する研究
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批准号:06F06712
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2006
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负责人:五斗 進
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依托单位:
アロステリックおよび転写調節による代謝ネットワークの制御に関する研究
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批准号:05F05439
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2005
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负责人:五斗 進
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依托单位:
アラキドン酸・リノレン酸経路における炎症の化学伝達物質に関する代謝系データベースの開発
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批准号:04F04910
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2004
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负责人:五斗 進
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依托单位:
環境汚染物質に対する肺プロテオーム・メタボロームの応答に関するバイオインフォマティクス研究
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批准号:04F04770
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2004
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负责人:五斗 進
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依托单位:
海外基金