权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

アロステリックおよび転写調節による代謝ネットワークの制御に関する研究

通过变构和转录调节控制代谢网络的研究

基本信息

批准号：
05F05439
负责人：
五斗進
金额：
$ 1.54万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

代謝系は生体内で必要とされる化合物やエネルギーを生成したり、不要物を分解して再利用したりするために細胞内で働くシステムであり、全ての生物に必須の機能である。代謝系は外界からの刺激など環境の変化に素早く応答する必要があり、また、必要な化化合物を必要なだけ合成するために、細胞内の低分子化合物による制御機構を進化させてきた。本研究では、代謝系が制御されている仕組みを、低分子による制御を中心に、ネットワーク解析手法を用いて明らかにすることを目的としている。本年度は、主にアロステリック制御と競合制御、フィードバックとフィードフォワード、阻害と活性化についてネットワークという観点から大腸菌の代謝系を解析した。その結果、制御に関わるループの長さは活性化制御に比べ阻害制御の方がかなり短いことが分かった。しかしながら、アロステリック制御と競合制御についてはループの長さに関する有意な差は見られなかった。また、阻害制御にはフィードバックループが、活性化制御にはフィードフォワードループが、それぞれよく使われる傾向があった。これらの結果は、代謝系全体におけるフィードバック制御とフィードフォワード制御の使われ方を反映していると考えられる。本年度はさらに転写制御と代謝制御との関連を調べるために、オペロン構造と代謝のループ構造との関連を解析した。その結果、オペロンを構成している遺伝子の方がそれ以外の遺伝子に比べ、低分子化合物による制御を受けている傾向が観察された。しかしながら、転写制御と代謝制御の間には明らかな相関は見られなかった。

Metabolizing system is essential for the production and reuse of compounds in vivo and for the function of all organisms. Metabolizing system is necessary to respond to environmental stimuli, to synthesize essential chemical compounds, and to control the evolution of intracellular low molecular weight compounds. In this study, the metabolic system is controlled by the middle group, the low molecular weight is controlled by the middle group, and the low molecular weight is controlled by the middle group. This year, we will analyze the metabolic system of coliform bacteria in the following ways: control, competition, inhibition, activation, etc. As a result, the control system is longer than the active control system. The difference between the two is that the two sides have different views on each other. For example, if you want to use a computer, you can use a computer. The result is that the metabolic system as a whole is reflected in the system. This year, we analyzed the relationship between structure and metabolism. As a result, the composition of the compounds in the medium and the ratio of the compounds in the medium and the low molecular weight compounds in the medium have been observed. In the meantime, we can see that there is no relationship between the two.