活性型ペプチド結合構造の解明を目指した新規自由回転型イソスターの合成と機能評価
活性型ペプチド結合構造の解明を目指した新規自由回転型イソスターの合成と機能評価
批准号:
10J02083
负责人:
小林 数也
金额:
$0.9万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2010
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2010 至 2011
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英文摘要
GPCRの一種であるケモカイン受容体CXCR4は、癌の増殖や転移、HIV感染などの病態への関与が知られている。所属研究室ではこれまでに強力なCXCR4アンタゴニスト活性を有する環状ペンタペプチドFC131を見出している。申請者は、活性への寄与が示唆されているD-Tyr-Argジペプチド結合周辺の構造活性相関研究に着手し、前年度までに4種類のアルケン型ジペプチドイソスターを導入した誘導体の合成とそれらの活性評価、及びNMRデータに基づく分子動力学計算による最安定構造の算出を行った。本年度の研究において申請者は、最近報告されたCXCR4の共結晶構造とFC131のNMR構造を用いたドッキングシミュレーションを行った。さらに得られた結合構造に基づいて合成した4種類のFC131誘導体のCXCR4との結合構造を算出することで、活性の変化を合理的に説明可能な推定結合構造を得た。また、これまでに報告されているFC131誘導体の中で最も高い活性を有するFC122は、FC131とは異なる結合様式で受容体に結合していることを示す結果を得た。上記と並行して、鉄キレート性環状ヘキサペプチド・デフェリフェリクリシンの構造機能相関研究に着手した。デフェリフェリクリシンは、3つの連続するアミノ酸側鎖にヒドロキサム酸を有する興味深い構造の環状ペプチドである。申請者は、Fmoc固相合成法に適用可能な側鎖にヒドロキサム酸を有する非天然アミノ酸ユニットを合成し、本アミノ酸ユニットを用いた汎用性の高いデフェリフェリクリシン誘導体の合成法を確立した。また、金属キレート性官能基であるヒドロキサム酸は鉄以外の金属にも配位することに着目し、合成したデフェリフェリクリシンの各種金属キレート錯体の探索を行ったところ、ジルコニウム及びチタンと配位した2種類の新規金属キレート錯体を同定した。
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アルケン型ジペプチドイソスターの合成とCXCR4拮抗剤FC131の構造活性相関研究への応用
烯烃型二肽等排体的合成及其在CXCR4拮抗剂FC131构效关系研究中的应用
DOI:
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发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kobayashi K, et al, 小林数也]
通讯作者:
小林数也
Synthesis and Application of Tetrasubstituted Alkene-type Dipeptide Isosteres as N-Methylamide Equivalent
N-甲基酰胺等价四取代烯烃型二肽电子等排体的合成及应用
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
Peptides : Proceedings of the 22nd American Peptide Symposium
影响因子:
--
作者:
[Kobayashi K., et al]
通讯作者:
et al
Stereoselective Synthesis of Tyr-Orn Type Alkene Dipeptide Isosteres and Their Application to Bioactive Peptides
Tyr-Orn型烯烃二肽电子等排体的立体选择性合成及其在生物活性肽中的应用
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
PEPTIDE SCIENCE 2010
影响因子:
--
作者:
[Kobayashi K., et al.]
通讯作者:
et al.
Structure-activity Relationship Study on a CXCR4 Antagonist FC131 Using Alkene-type Dipeptide Isosteres
利用烯烃型二肽电子等排体研究CXCR4拮抗剂FC131的构效关系
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kobayashi K, et al]
通讯作者:
et al
Synthesis of Alkene-type Dipeptide Isosteres and Its Application to Structure-activity Relationship Study on a CXCR4 Antagonist FC131
烯烃型二肽电子等排体的合成及其在CXCR4拮抗剂FC131构效关系研究中的应用
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kobayashi K., et al.]
通讯作者:
et al.
共 7 条
Development of novel macrocyclic BACE1 inhibitors for preventive or therapeutic agents for Alzheimer's disease
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批准号:23K06058
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2023
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负责人:小林 数也
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依托单位:
Development of a versatile design method for protease inhibitors based on hydroxyproline
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批准号:20K06953
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.83万
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财政年份:2020
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负责人:小林 数也
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依托单位:
海外基金