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リボソームタンパク質を指標としたMALDI-MS測定による微生物迅速同定法の確立

以核糖体蛋白为指标的MALDI-MS测定快速微生物鉴定方法的建立

基本信息

批准号：
10J09080
负责人：
堀田雄大
金额：
$ 0.9万
依托单位：
Meijo University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2011
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10J09080/
关键词：
微生物同定法 MALDI-MS リボソームタンパク質 S10-spc-alphaオペロン S10-GERMS法

项目摘要

リボソームタンパク質に基づくMALDI-MSによる微生物迅速同定法を発展させるには、データベースの充実が必須である。そこで、1.MALDI-MSを用いた微生物同定(S10-GERMS法)のSphingomonadaceae科細菌への適用および2.S10-GERMS法の乳酸菌への適用によりデータベースの蓄積および実証試験を行った。本研究では、S10-spc-alphaオペロンの塩基配列を決定するために、科レベルで使用可能なプライマーセットを構築し、シークエンシングにより塩基配列を決定した。塩基配列に基づき、リボソームタンパク質の理論質量を算出することで、リボソームタンパク質データベースを構築した。Sphingomonadaceae科のType strainは、本データベースの構築およびMALDI-TOF MS測定により、迅速な微生物同定が可能となっただけでなく、S10-GERMS法は、16S rRNA遺伝子における1塩基の違いが、MALDI-TOF MS測定により、明確に識別が可能であることを実証した(計画1)。乳酸菌における株(亜種)レベルの識別の実証試験には、Lactobacillus属およびLactobcoccus属を対象とした。S10-GERMS法による比較では、Lactobacillus paracaseiの亜種およびそれらの近縁種において、L23,L24およびS13の違いが、識別のために有用なバイオマーカーであることが実証された。Lactococcus lactis subsp.lactis、subsp.hordniaeおよびsubsp.cremorisの3亜種の識別は、MALDIマススペクトルの結果から、リボソームタンパク質サブユニットL18が識別に重要なバイオマーカーであることが立証された。

It is necessary to determine the importance of rapid MALDI-MS assays and rapid microbiological assays. The bacteria of Sphingomonadaceae family were determined by microorganism (S10-GERMS method). The lactic acid bacteria (lactic acid bacteria) by 2.S10-GERMS method and lactic acid bacteria (Lactobacillus). The purpose of this study is to determine the basis of the determination of the basis of the research, the S10-spc-alpha and the science of the study. This is the basis for the calculation of the basic data, the basic information, the basic information, the theory, the calculation, the calculation, the calculation and the calculation. Sphingomonadaceae Type strain, this equipment, the MALDI-TOF MS test, the rapid microbiological assay, the S10-GERMS assay, the 16s rRNA assay, the MALDI-TOF MS assay, the explicit identification protocol, the detection protocol (Plan 1). The strains of lactic acid bacteria (species), the strains of lactic acid bacteria, the strains of lactic The S10-GERMS method has been used to compare all kinds of products, such as Lactobacillus paracasei, L23, L24, S13, and so on. Lactococcus lactis subsp.lactis, subsp.hordniae, subsp.cremoris, and MALDI have been tested for more than 3 categories. The results of the results have been verified. Do not need to know if you are going to use L18. Please do not register for any important information.