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硝酸蓄積硫黄酸化細菌の機能と湖沼生態系における物質循環への関与の解明

阐明积累硝酸盐的硫氧化细菌的功能及其参与湖泊生态系统物质循环的作用

基本信息

批准号：
10J56032
负责人：
根本富美子
金额：
$ 0.9万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2011
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10J56032/
关键词：
硫黄酸化細菌硝酸還元淡水湖沼微生物生態学

项目摘要

本研究では、湖沼底泥中に生息する大型の糸状性硫黄酸化細菌Thioplocaの包括的な理解のため、系統解析および生態学的・生理学的特性の解明を目的とした。オコタンペ湖の試料から複数タイプのITS領域配列が得られたため、タイプごとの垂直分布を調査したが、生息地の深さによるITS領域配列タイプの違いは見られなかった。カンボジアのトンレサップ湖で採取されたThioplocaの糸状性生物の形態観察および系統解析を行った結果、Thioplocaが熱帯域にも分布していることが初めて示された。富栄養化が深刻であり物質循環に関する研究が求められるトンレサップ湖において、窒素、硫黄、炭素の循環に影響を与え得るThioplocaの存在が確認されたことは、重要な知見であると考えられた。プロテオーム解析によりThioplocaの生理学的特性の推定を行った。その結果、生息地において脱窒、ジメチルスルフォキシド(DMSO)呼吸および酸素呼吸活性を有し、炭酸固定を行っていることが推定された。また、細胞付近の酸素濃度の測定を行ったところ、細胞に近づくほど酸素濃度が低下する傾向がみられ、Thioplocaの酸素呼吸能が支持される結果が得られた。これらの結果は、これまで不明であったThioplocaの生理学的特性の理解を大きく前進させるものと考えられた。Thioplocaのシース付着菌の群集構造解析を行ったところ、糸状性のchloroflexi門の細菌がシースに大量に分布していることが示された。この細菌の近縁種には多糖類を分解して発酵を行う細菌が存在することから、この付着菌はThioplocaのシースを炭素源やエネルギーとして利用している可能性が考えられた。現在のところ、特異的付着菌の生理学的特性は不明であるが、硝酸蓄積硫黄酸化細菌の生存戦略の解明につながる結果であると考えられた。

The purpose of this study is to understand the physiological characteristics of large-scale sulfuric acid bacteria Thioploca in the sediments of lake and marsh, including understanding and systematic analysis of physiological characteristics of physiology. In the field of ITS, the data are distributed vertically, and the places of interest are distributed vertically, and the places of interest are distributed in the ITS field. In this paper, the results of the analysis of the Thioploca system, the results of the analysis of the system, and the results of the distribution of the Thioploca domain are analyzed. The results show that the data are distributed in the field. In-depth environmental research is required to determine the presence of trace amounts of carbon, asphyxiate, sulfur, carbon and Thioploca in the environment. The physiological properties of Thioploca are presumptive. The results showed that there was no significant difference in the respiratory activity of acid in the air between the two groups (DMSO). The results showed that the respiratory activity of acid in the air was significantly higher than that in the control group (DMSO). The levels of acidity, acidity and respiratory energy of Thioploca were measured. The results showed that the respiratory energy of acid could support the results. The results of this study show that the physiological characteristics of Thioploca are not known. Thioploca infected bacteria cluster analysis showed that there was a large number of bacteria distributed in a large number of lines, such as chloroflexi bacteria and phenotypic bacteria. In recent years, several kinds of polysaccharides have been used to decompose yeast. There are many strains in the bacteria, such as Thioploca, carbon source, carbon source and so on. At present, the physiological characteristics of pathogenic bacteria are unknown, and the survival of thioacid-acidified bacteria with nitric acid storage is not clear.