タンパク質活性部位近傍構造の部位選択的ダイナミクス観測法の開発

蛋白质活性位点附近结构的位点选择性动力学观察方法的发展

• 批准号: 21655006
• 负责人: 水谷 泰久
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21655006/
• 关键词: ラマン分光法; 生物物理; 時間分解分光法

昨年度改良を加えた測定装置を用いて、種々のヘムタンパク質およびモデル化合物のハイパー共鳴ラマンスペクトル測定を行った。ヘムタンパク質とモデル化合物とのスペクトルを比較することにより、ヘムに由来するラマンバンドを帰属すると同時に、ヘム近傍に存在するアミノ酸残基の観測の可能性を探った。一酸化炭素結合形ミオグロビンで観測されたバンドのうち、1225 cm-1に観測されたバンドは、ヘムのモデル錯体では観測されなかった。このバンドはヘム近傍に存在するアミノ酸残基のラマンバンド強度が振電相互作用によって増強されている可能性がある。そこで、このバンド強度のpH依存性を調べたところ、pKa=4.5の解離基を仮定するとうまく説明できることがわかった。ヘムに結合した一酸化炭素の、Fe-CO伸縮振動およびCO伸縮振動バンドのpH依存性においても類似した振る舞いが報告されていることから、1225cm-1のラマンバンドはヘムの遠位側に存在するアミノ酸残基に由来すると考えられる。また、220cm-1付近に、ヘム鉄-近位ヒスチジン間の伸縮振動バンドに帰属可能なラマンバンドが観測された。このバンドは、ヘモグロビン、ペルオキシダーゼのほかのヘムタンパク質についても観測された。カタラーゼについて、ヘムに配位したチロシンに由来するラマンバンドを3本観測した。これらは、C-C伸縮振動(1522,1612cm-1)、C-0伸縮振動(1244cm-1)に帰属できる。ここに挙げたバンド以外にもアミノ酸残基由来と考えられるラマンバンドを検出することができた。

An improved system for the determination of chemical and biological compounds has been developed. To explore the possibility of detecting the presence of acid residues in the vicinity of the target compound. An acidified carbon bond is formed by the following steps: measuring the temperature at 1225 cm-1; measuring the temperature at 1225 cm-1; measuring the temperature at 1225 cm-1; measuring the temperature at 1225 cm-1; and measuring the temperature at 1225 cm-1. The presence of acid residues in the vicinity of these molecules increases the likelihood of electro-vibrational interactions. The pH dependence of pKa, pKa=4.5 and pKa=4.5 are regulated. The pH dependence of the Fe-CO stretching vibration and CO stretching vibration in combination with an acidified carbon atom is similar to that of the 1225cm-1 stretching vibration. 220cm-1 near, iron-near position, stretching vibration, and possible vibration. This is the first time I've ever seen a woman who's had sex with someone else. The first step in the process of coordination is to establish a coordination mechanism between the two groups. C-C stretching vibration (1522,1612cm-1), C-0 stretching vibration (1244cm-1) belong to The origin of the acid residue is unknown.