ガスセンサータンパク質の化学反応と信号伝達
ガスセンサータンパク質の化学反応と信号伝達
批准号:
19029029
负责人:
水谷 泰久
金额:
$1.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 --
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FixLは根粒菌由来の酸素(O2)センサーヘムタンパク質で、N末端側のヘムを含むセンサードメインと、C末端側のキナーゼドメインからなる。高酸素条件ではヘムはO_2結合形になりキナーゼ不活性で、低酸素条件ではO_2解離形となりキナーゼ活性となる。FixLの機能発現機構を理解するためには、リガンドの脱着に伴ってどのような構造変化が誘起されるのかを明らかにすることが重要である。本研究では、全長タンパク質およびセンサードメインについて、時間分解共鳴ラマン分光法を用いて、O_2およびCO光解離に伴うへみの構造ダイナミクスを調べた。O_2解離の場合、v(Fe-His)、γ7、v8バンドについて、サブマイクロ秒からマイクロ秒にかけてバンド強度の変化が観測された。一方、CO解離では、このような強度変化は観測されなかった。したがって、これらめバンド強度の変化は、FixLのリガンド識別およびO_2検知に関与する構造変化に由来すると考えられる。また、CO解離、O_2解離ともに、全長タンパク質ではセンサードメインのみのものに比べて構造変化の速度が遅くなった。これは、構造変化がキナーゼドメインと連動していることを強く示唆する。得られたデータを基にして、リガンド解離に伴う構造変化のモデルを提案した。本研究の結果は、FGループのシフトがキナーゼ活性の抑制に作用するという仮説を支持するとともに、ヘムのドーミングが複合的にFixLのキナーゼ活性を制御しているということを示唆する。次に明らかにすべき点は、タンパク質部分の構造変化である。Tyr、Trp、Pheなどの芳香族アミノ酸残基は200〜300nmに吸収帯を持っているので、紫外光を用いることでこれらのアミノ酸残基の共鳴ラマンスペクトルを選択的に測定することができる。タンパク質部分の構造変化とヘムの構造変化とがどのように連動して起きているかが明らかになれば、センサータンパク質の情報伝達機構の解明に大きく近づくと考えちれる。
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タンパク質ダイナミクスと水素結合
蛋白质动力学和氢键
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[M., Murata, T., Odagiri, N., Kouchi, H. Y. Zhou, 水野操, 森田繁, 森田繁, Yasuhisa Mizutani, 後藤基志, 水谷泰久]
通讯作者:
水谷泰久
Picosecond protein dynamics of myoglobin upon ligand dissociation studied by ultraviolet resonance Raman spectroscopy
紫外共振拉曼光谱研究配体解离时肌红蛋白的皮秒蛋白质动力学
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[T., Nakazato, T., Odagiri, K., Yachi, L., Ishikawa, H., Fukuzawa, H., Miyagi, M., Kitajima, N., Kouchi, Y. Mizutani]
通讯作者:
Y. Mizutani
時間分解共鳴ラマン分光法によるタンパク質ダイナミクスの観測:構造変化と機能
通过时间分辨共振拉曼光谱观察蛋白质动力学:结构变化和功能
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[T. Odagiri, M. Murata, K. Funatsu, T. Tanabe, I. H. Suuki, M. Kitajima, and N. Kouchi, 水谷泰久]
通讯作者:
水谷泰久
The formation of hydrogen bond in the proximal heme pocket ofHemAT-Bs upon ligand binding
配体结合后 HemAT-B 近端血红素袋中氢键的形成
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Biochem.Biophys.Res.Commun 357
影响因子:
--
作者:
[Hirokazu IWAWAKI, Isao SINOHARA, Toshikazu KATO, Hideaki Yoshimura]
通讯作者:
Hideaki Yoshimura
みず学への誘い
水研究邀请
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[久保孝史(共著), 大垣一成・江頭靖幸・渡會仁・松村道雄・中辻啓二(編著)]
通讯作者:
大垣一成・江頭靖幸・渡會仁・松村道雄・中辻啓二(編著)
共 9 条
Allostery and Function Created by Highly Packed Protein Structures
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批准号:23H00285
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$30.37万
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财政年份:2023
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
タンパク質内無輻射遷移を利用した分子ヒーターの創成と細胞熱操作技術の開発
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批准号:23K17359
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
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资助金额:$16.64万
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财政年份:2023
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
タンパク質活性部位近傍構造の部位選択的ダイナミクス観測法の開発
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批准号:21655006
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2009
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
マイクロ秒1分子ダイナミクス観測法の開発とそれを用いた蛋白質反応素過程の研究
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批准号:17655008
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2005
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
化学反応に関わる媒質としてのタンパク質の超高速構成ダイナミクス
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批准号:13740340
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2001
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
液相中における反応余剰エネルギーの散逸機構の解明
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批准号:11740339
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1999
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
液相中における反応余剰エネルギーの散逸機構の解明
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批准号:09740448
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1998
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
レーザーパルス温度ジャンプ法を用いた構造ダイナミクスの協同性に関する研究
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批准号:08740472
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1996
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
サーザーパルス温度ジャンプ法を用いた蛋白質の構造ダイナミクスに関する研究
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批准号:07740474
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1995
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
海外基金