化学反応に関わる媒質としてのタンパク質の超高速構成ダイナミクス
化学反応に関わる媒質としてのタンパク質の超高速構成ダイナミクス
批准号:
13740340
负责人:
水谷 泰久
金额:
$1.54万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2002
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英文摘要
CO結合形ヘモグロビン(Hb)についてCO光解離による構造ダイナミクスを調べた。ヘム鉄とそれに結合したヒスチジンとの間の伸縮振動[v(Fe-His),約220cm^<-1>]バンドに注目した。ミオグロビン(Mb)の場合と同様に、このバンドについて時定数99ピコ秒で大きさ1.8cm^<-1>の振動数シフトと、10±5ピコ秒の時定数をもつバンド幅の増加が観測された。Mbの場合は、1ナノ秒でのv(Fe-His)振動数とデオキシ形のそれとはかなり近かったが、Hbの場合は9cm^<-1>の振動数の差がみられた。この差は、マイクロ秒の時間領域で起きる四次構造変化によるものである。また、1ナノ秒でのバンド幅はデオキシ形に比べやや狭かった。MbとHbの結果から、バンド形を精度よく測定することで不均一分布の変化を検出できることがわかった。大腸菌より得た酸素ガスセンサータンパク質(E. coli DOS)のヘム近傍構造を、共鳴ラマン分光法を用いて明らかにした。還元形および酸化形ともにpH4-10で典型的な6配位低スピン型ヘムの共鳴ラマンスペクトルを示した。リガンド結合形ヘムを光励起しリガンドを光解離させると、典型的な5配位高スピン型ヘムの共鳴ラマンスペクトルが得られた。また、214cm^<-1>に鉄-ヒスチジン伸縮振動によるラマンバンドが観測された。解離後1ナノ秒のバンド強度は10ピコ秒のものとほとんど変わらなかったことから、リガンドの再結合は遅く解離形の寿命は10ナノ秒よりも長いということが明らかになった。また、95番のメチオニン残基をアラニン残基に置換した変異体(還元形)では5配位高スピン型ヘムによる共鳴ラマンスペクトルが得られた。これらの実験事実から、DOSの軸配位子はHis77とMet95であり、Met95が配位子として酸素分子と置き換わることによってDOSの活性化が起きることが示唆された。
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水谷泰久: "タンパク質の動きについて最近考えていること"物性研究. 76. 127-133 (2001)
Yasuhisa Mizutani:“蛋白质运动的最新思考”凝聚态材料研究 76. 127-133 (2001)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Sergei G.Kruglik: "Time-Resolved Resonance Raman Study of the Exciplex Formed Between Excited Cu-Porphyrin and DNA"J. Phys. Chem. B. 105. 5018-5031 (2001)
Sergei G.Kruglik:“激发铜卟啉和 DNA 之间形成的激基复合物的时间分辨共振拉曼研究”J。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Yasuhisa Mizutani: "Ultrafast Dynamics of Myoglobin Probed by Time-resolved Resonance Raman Spectroscopy"The Chemical Record. 1. 258-275 (2001)
Yasuhisa Mizutani:“通过时间分辨共振拉曼光谱探测肌红蛋白的超快动力学”化学记录。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Yasuhisa Mizutani: "Slow Vibrational Energy Redistribution in Phenyl Peripherals of Nickel Tetraphenylporphyrin Probed by Picosecond Time-resolved Resonance Raman Spectroscopy"Bull. Chem. Soc. Jpn.. 75. 965-971 (2002)
Yasuhisa Mizutani:“通过皮秒时间分辨共振拉曼光谱探测镍四苯基卟啉的苯基外围的慢振动能量重新分布”公牛。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Yasuhisa Mizutani: "Ultrafast Structural Relaxation of Myoglobin Following Photodissociation of Carbon Monoxide Probed by Time-resolved Resonance Raman Spectroscopy"J. Phys. Chem. B. 105. 10992-10999 (2001)
Yasuhisa Mizutani:“通过时间分辨共振拉曼光谱探测一氧化碳光解后肌红蛋白的超快结构弛豫”J。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 8 条
Allostery and Function Created by Highly Packed Protein Structures
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批准号:23H00285
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$30.37万
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财政年份:2023
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
タンパク質内無輻射遷移を利用した分子ヒーターの創成と細胞熱操作技術の開発
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批准号:23K17359
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
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资助金额:$16.64万
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财政年份:2023
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
タンパク質活性部位近傍構造の部位選択的ダイナミクス観測法の開発
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批准号:21655006
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2009
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
ガスセンサータンパク質の化学反応と信号伝達
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批准号:19029029
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2007
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
マイクロ秒1分子ダイナミクス観測法の開発とそれを用いた蛋白質反応素過程の研究
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批准号:17655008
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2005
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
液相中における反応余剰エネルギーの散逸機構の解明
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批准号:11740339
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1999
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
液相中における反応余剰エネルギーの散逸機構の解明
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批准号:09740448
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1998
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
レーザーパルス温度ジャンプ法を用いた構造ダイナミクスの協同性に関する研究
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批准号:08740472
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1996
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
サーザーパルス温度ジャンプ法を用いた蛋白質の構造ダイナミクスに関する研究
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批准号:07740474
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1995
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负责人:水谷 泰久
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依托单位:
海外基金