High pressure protein crystal structure analysis

高压蛋白质晶体结构分析

基本信息

  • 批准号:
    21657027
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.18万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 财政年份:
    2009
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2009 至 2011
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

In order to elucidate the mechanism of pressure adaptation of proteins, we have developed structural studies of proteins by a high-pressure protein crystallography method using a diamond-anvil cell. IPMDH from the deep-sea bacterium Shewanella benthica DB21MT-2 is more tolerant towards HP stress than its counterpart from the land bacterium S. oneidensis MR-1, even though these two enzymes share 85% amino-acid identity. Crystal structures of IPMDH have been determined at about 2 A resolution under pressures ranging from 0. 1 to 650 MPa. Penetration of water molecules into IPMDH is observed at high-pressure, and relationship of the structure and pressure resistance has been elucidated.
为了阐明蛋白质的压力适应机制,我们利用金刚石砧细胞,采用高压蛋白质晶体学方法对蛋白质进行了结构研究。来自深海底栖希瓦氏菌DB21MT-2的IPMDH比来自陆地细菌S. oneidensis MR-1的IPMDH对HP胁迫的耐受性更强,尽管这两种酶有85%的氨基酸相同。IPMDH的晶体结构已在2 A分辨率下测定,压力范围为0。1 ~ 650mpa。在高压下观察了水分子对IPMDH的渗透,并阐明了结构与耐压性的关系。

项目成果

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专著数量(0)
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会议论文数量(0)
专利数量(0)
High-Pressure Macromolecular Crystallography at PF
PF 高压高分子晶体学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Chavas L. M. G;Nagae T;Watanabe NHiraki M;Yamada Y;Igarashi N;Matsugaki N;Wakatsuki S
  • 通讯作者:
    Wakatsuki S
Shewanella属好圧性細菌由来3-isopropylmalate dehydrogenaseの高圧結晶構造解析
希瓦氏菌属嗜压细菌来源的 3-异丙基苹果酸脱氢酶的高压晶体结构分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    永江峰幸;河村高志;Leonard Chavas;加藤千明;渡邉信久
  • 通讯作者:
    渡邉信久
High-pressure-induced water penetration into 3-isopropylmalate dehydrogenase
高压诱导水渗透至 3-异丙基苹果酸脱氢酶
  • DOI:
    10.1107/s1744309112001443
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Nagae;T.;Kawamura;T.;Chavas;LMG.;Niwa;K.;Hasegawa;M.;Kato;C. and Watanabe;N.
  • 通讯作者:
    N.
高圧蛋白質結晶構造解析
高压蛋白质晶体结构分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    永江峰幸,河村高志;Leonard Chavas,丹羽健,長谷川正,加藤千明,渡邉信久
  • 通讯作者:
    Leonard Chavas,丹羽健,長谷川正,加藤千明,渡邉信久
Shewanella属好圧性細菌由来3-isopropylmalate dehydrogenaseの結晶構造解析と圧力耐性の構造基盤
希瓦氏菌嗜压菌3-异丙基苹果酸脱氢酶的晶体结构分析及耐压结构基础
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    永江峰幸;河村高志;山根隆;加藤千明;渡邉信久
  • 通讯作者:
    渡邉信久
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    2020
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    $ 2.18万
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