Development of novel methods for sequence comparison in the era of massive DNA sequencing data
Development of novel methods for sequence comparison in the era of massive DNA sequencing data
海量DNA测序数据时代序列比对新方法的开发
批准号：
22310124
负责人：
GOTOH Osamu
金额：
$11.73万
依托单位：
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2010 至 2012
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英文摘要
We focused on middle-to-long DNA reads generated by new generation sequencers, and developed a computer program named “Spaln” that maps and spliced-align a set of transcripts onto reference genomic sequences. When tested on full length cDNA or protein ami
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A Method for fast and space-efficient whole-genome sequence alignment, in Proceeding of the 5th International Conference
一种快速且节省空间的全基因组序列比对方法，第五届国际会议论文集
一种快速且节省空间的全基因组序列比对方法，第五届国际会议论文集
DOI：
--
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
--
作者：
[Nakato, R. and Gotoh, O]
通讯作者：
O
RDF Curator : A Novel Workflow that Generates Semantic Graph from Literature for Curation Using Text Mining
RDF Curator：一种新颖的工作流程，使用文本挖掘从文献中生成语义图以进行策展
RDF Curator：一种新颖的工作流程，使用文本挖掘从文献中生成语义图以进行策展
DOI：
--
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
--
作者：
[Komiyama, Y., Gotoh, O.]
通讯作者：
O.
A Method for fast and space-efficient whole-genome sequence alignment
一种快速且节省空间的全基因组序列比对方法
一种快速且节省空间的全基因组序列比对方法
DOI：
--
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
--
作者：
[Nakato, R., Gotoh, O.]
通讯作者：
O.
Mapping middle-to-long RNA-seq reads onto genomic sequence
将中长 RNA-seq 读段映射到基因组序列上
将中长 RNA-seq 读段映射到基因组序列上
DOI：
--
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
作者：
[Zeng, C., Iwata, H., Gotoh, O]
通讯作者：
O
バイオインフォマティクス
生物信息学
生物信息学
DOI：
--
发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
--
作者：
[I.Yamada, M.Yukawa, M.Yamagishi, 松浦正明]
通讯作者：
松浦正明
共 23 条
Exploration of CTCF downstream targets in endometrial cancer
-
批准号：20K09634
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项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额：$2.75万
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财政年份：2020
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负责人：GOTOH Osamu
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依托单位：
海外基金