Method and Practice of Phylogenomics

系统基因组学方法与实践

基本信息

  • 批准号:
    22570099
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2010
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2010 至 2012
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Problems misleading in the phylogenetic analyses of genome-scale data were studied, and methods to overcome these problems were developed. (1)The method for testing whether there existed the Universal Common Ancestor for all extant species on Earth was evaluated. (2)Based on a population genetic analysis of nuclear genomes, we obtained an evidence for the hypothesis that the polar bear evolved from a local population of the brown bear, that is, the brown bear is not monophyletic. (3)It was shown that several misleading signals in the eutherian tree of mitochondrial genomes are relieved by increasing the density of taxon sampling.
研究了基因组数据系统发育分析中存在的问题,并提出了解决这些问题的方法。(1)对地球上所有现存物种是否存在共同祖先的检验方法进行了评价。(2)通过种群核基因组遗传分析,为北极熊是从棕熊的一个本地种群进化而来的假说提供了证据,即棕熊不是单系进化的。(3)研究表明,增加分类群取样密度可以减轻真核线粒体基因组树中的一些误导信号。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
新図説・動物の起源と進化
新插图:动物的起源和进化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Fukuda;T. &Ikeda;H.;鶴崎展巨 ・Marshal Hedin ・田中 孟・戸田 守;長谷川政美
  • 通讯作者:
    長谷川政美
Divergence and convergence in evolution
进化中的分歧与趋同
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ikeda;H.;Yamamoto;N. Kobayashi;T. & Murata;J.;鶴崎展巨・Marshal Hedin・田中孟・戸田守;古屋秀隆;M. Hasegawa
  • 通讯作者:
    M. Hasegawa
The human‐chimpanzee‐gorilla problem in the post‐genomic era
后基因组时代的人类-黑猩猩-大猩猩问题
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ohashi;H. ;Tateishi;Y. & Ikeda;H.;M. Hasegawa
  • 通讯作者:
    M. Hasegawa
Stability of mitochondrial membrane proteins in terrestrial vertebrates predicts aerobic capacity and longevity.
  • DOI:
    10.1093/gbe/evr079
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Kitazoe Y;Kishino H;Hasegawa M;Matsui A;Lane N;Tanaka M
  • 通讯作者:
    Tanaka M
The Position of Gnetales among Seed Plants: Overcoming Pitfalls of Chloroplast Phylogenomics
裸子植物在种子植物中的地位: 克服叶绿体系统发生组学的陷阱
  • DOI:
    10.1093/molbev/msq170
  • 发表时间:
    2010-12-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    10.7
  • 作者:
    Zhong, Bojian;Yonezawa, Takahiro;Hasegawa, Masami
  • 通讯作者:
    Hasegawa, Masami
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  • 通讯作者:
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Evolution on islands controlled by bottom-up allochthonous inputs and top-down cascading predation
由自下而上的异地输入和自上而下的级联捕食控制的岛屿进化
  • 批准号:
    19H03307
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
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Interplay between co-evolution and population dynamics in the predator - prey relationship in the island environments
岛屿环境中捕食者-被捕食者关系中协同进化与种群动态之间的相互作用
  • 批准号:
    15H04426
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    2015
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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  • 批准号:
    25293463
  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 2.66万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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岛屿环境中猎物和捕食者的群落组装和适应性进化
  • 批准号:
    24570031
  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Dietary shift of predator in insular environment : evaluation of relative importance of natural selection and gene flow to phenotypic evolution
岛屿环境中捕食者的饮食转变:评估自然选择和基因流对表型进化的相对重要性
  • 批准号:
    21570024
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 2.66万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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抑郁症自杀行为患者叙事方法的开发
  • 批准号:
    21390599
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    2009
  • 资助金额:
    $ 2.66万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Developmental processes of evolutionary gain and loss of anti-predatory traits
反掠食性特征的进化获得和丧失的发展过程
  • 批准号:
    19570026
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
A study of suicide prevention by the narrative approach for the depression patients
抑郁症患者叙事预防自杀的研究
  • 批准号:
    18592414
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Symbiosis and diversity in the biosystem of Madagascar
马达加斯加生物系统的共生与多样性
  • 批准号:
    15255007
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
Origin and evolution of plastid-like organella in Apicomplexa
顶端复合体类质体细胞器的起源和进化
  • 批准号:
    13640709
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

相似海外基金

復元再抽出による疑似標本の漸近正規性を用いたセミパラメトリック最尤法の開発
通过恢复性重采样开发使用伪样本渐近正态性的半参数最大似然法
  • 批准号:
    22K01425
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
最尤法による分子系統樹推定法の研究
基于最大似然法的分子系统发育树估计方法研究
  • 批准号:
    00F00329
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
最尤法による分子進化の並列解析システムの開発
使用最大似然法开发分子进化并行分析系统
  • 批准号:
    07249203
  • 财政年份:
    1995
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
最尤法によるゲノム情報の並列多重解析システムの開発
利用最大似然法开发基因组信息并行多重分析系统
  • 批准号:
    06249205
  • 财政年份:
    1994
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
種々のモデルにおける条件付最尤法の性能と数理
条件最大似然法在各种模型中的性能和数学
  • 批准号:
    63530016
  • 财政年份:
    1988
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
ANESTHESIA FOR CIRCUMCISION--WHAT IS THE BEST METHOD?
包皮环切术的麻醉——最好的方法是什么?
  • 批准号:
    5218676
  • 财政年份:
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
ANESTHESIA FOR CIRCUMCISION--WHAT IS THE BEST METHOD?
包皮环切术的麻醉——最好的方法是什么?
  • 批准号:
    2479563
  • 财政年份:
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
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知道了