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Method and Practice of Phylogenomics

Method and Practice of Phylogenomics
系统基因组学方法与实践
批准号：
22570099
负责人：
HASEGAWA Masami
金额：
$2.66万
依托单位：
The Institute of Statistical Mathematics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2010 至 2012
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22570099/
关键词：
系統樹推定最尤法モデル比較ゲノム連結配列ミトコンドリアゲノム系統学種系統樹集団系統樹遺伝子系統樹ミトコンドリア系統樹種サンプリング適応的進化中立的進化家畜化UCA仮説アラインメント分子系統学機能的制約モデル分子進化グネツムAIC

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Problems misleading in the phylogenetic analyses of genome-scale data were studied, and methods to overcome these problems were developed. (1)The method for testing whether there existed the Universal Common Ancestor for all extant species on Earth was evaluated. (2)Based on a population genetic analysis of nuclear genomes, we obtained an evidence for the hypothesis that the polar bear evolved from a local population of the brown bear, that is, the brown bear is not monophyletic. (3)It was shown that several misleading signals in the eutherian tree of mitochondrial genomes are relieved by increasing the density of taxon sampling.
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会议论文
新図説・動物の起源と進化
新插图：动物的起源和进化
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [Fukuda, T. &Ikeda, H., 鶴崎展巨 ・Marshal Hedin ・田中 孟・戸田 守, 長谷川政美]
通讯作者： 長谷川政美
Divergence and convergence in evolution
进化中的分歧与趋同
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [Ikeda, H., Yamamoto, N. Kobayashi, T. & Murata, J., 鶴崎展巨・Marshal Hedin・田中孟・戸田守, 古屋秀隆, M. Hasegawa]
通讯作者： M. Hasegawa
The human‐chimpanzee‐gorilla problem in the post‐genomic era
后基因组时代的人类-黑猩猩-大猩猩问题
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [Ohashi, H. , Tateishi, Y. & Ikeda, H., M. Hasegawa]
通讯作者： M. Hasegawa
Stability of mitochondrial membrane proteins in terrestrial vertebrates predicts aerobic capacity and longevity.
DOI： 10.1093/gbe/evr079
发表时间： 2011
期刊： Genome biology and evolution
影响因子： 3.3
作者： [Kitazoe Y, Kishino H, Hasegawa M, Matsui A, Lane N, Tanaka M]
通讯作者： Tanaka M
Evolution on islands controlled by bottom-up allochthonous inputs and top-down cascading predation
  • 批准号：
    19H03307
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $6.82万
  • 财政年份：
    2019
  • 负责人：
    HASEGAWA Masami
  • 依托单位：
    Toho University
Interplay between co-evolution and population dynamics in the predator - prey relationship in the island environments
  • 批准号：
    15H04426
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $9.07万
  • 财政年份：
    2015
  • 负责人：
    HASEGAWA Masami
  • 依托单位：
    Toho University
A development of approach for the depression and suicidal behavior people with Emotion Modulation Therapy (EMT)
  • 批准号：
    25293463
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $5.24万
  • 财政年份：
    2013
  • 负责人：
    HASEGAWA Masami
  • 依托单位：
    Kanazawa Medical University
Community assembly and adaptive evolution of prey and predator in insular environment
  • 批准号：
    24570031
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额：
    $3.41万
  • 财政年份：
    2012
  • 负责人：
    HASEGAWA Masami
  • 依托单位：
    Toho University
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