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Protein structural data mining based on the Neighborhood Fragment Spectra representation

Protein structural data mining based on the Neighborhood Fragment Spectra representation
基于邻域片段谱表示的蛋白质结构数据挖掘
批准号：
22500130
负责人：
KATO Hiroaki
金额：
$2.33万
依托单位：
Toyohashi University of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2010 至 2012
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22500130/
关键词：
分子構造情報処理三次元構造類似性タンパク質構造分類データマイニング分子生命情報学分子構造データベースタンパク質モチーフ近傍フラグメントタンパク質立体構造分子グラフ構造活性相関近傍フラグメントスペクトル

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In the present work, the author has proposed the Neighborhood Fragment Spectra (NFS) method to describe structural feature of a given molecule. It has applied for sequenceand structural similarity analysis of proteins using the reduced represe ntation of complex and large protein structures. The developed method including an automated classification of quaternary structures is one of the key technologies for protein structural data mining.
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会议论文
Three-dimensional protein structural data mining based on the NFS representation
基于NFS表示的三维蛋白质结构数据挖掘
DOI： --
发表时间： 2013
期刊：
影响因子： --
作者： [Hiroaki Kato, and Masaaki Iitsuka]
通讯作者： and Masaaki Iitsuka
系統樹表現に基づく分子の関係ネットワークの可視化システムの開発
基于系统发育树表示的分子关系网络可视化系统的开发
DOI： --
发表时间： 2012
期刊：
影响因子： --
作者： [檜山綾乃, 加藤博明]
通讯作者： 加藤博明
遺伝的アルゴリズムを用いた分子ライブラリデザインシステムの開発
利用遗传算法开发分子库设计系统
DOI： --
发表时间： 2013
期刊：
影响因子： --
作者： [森本孝朗, 加藤博明]
通讯作者： 加藤博明
構造活性相関研究のための分子の三次元特徴フラグメント辞書の作成
创建用于结构-活性关系研究的分子三维特征片段字典
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [松田貴人, 加藤博明]
通讯作者： 加藤博明
共 10 条
    Recognition of pathogen-derived sphingolipid in plants.
    • 批准号：
      20K15528
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    • 资助金额：
      $2.66万
    • 财政年份：
      2020
    • 负责人：
      KATO Hiroaki
    • 依托单位：
      Kyoto University
    Structural basis for discrimination between multi-drug exporters and lipid floppies
    • 批准号：
      19K22495
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额：
      $4.16万
    • 财政年份：
      2019
    • 负责人：
      KATO Hiroaki
    • 依托单位：
      Kyoto University
    Structural basis for optimization of molecular probe using P-glycoprotein in vivo imaging
    • 批准号：
      24659018
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.41万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      KATO Hiroaki
    • 依托单位：
      Kyoto University
    Studies on stability of fission yeast heterochromatin and its regulators
    • 批准号：
      21870024
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
    • 资助金额：
      $1.76万
    • 财政年份：
      2009
    • 负责人：
      KATO Hiroaki
    • 依托单位：
      Shimane University
    海外基金