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Detection and imaging of DNA methylation by artificial protein
人工蛋白检测DNA甲基化并成像
基本信息
- 批准号：22750162
- 负责人：
- 金额：$ 2.5万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份：2010
- 资助国家：日本
- 起止时间：2010 至 2011
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
To develop a new detection method of methylated DNA, an artificial protein/peptide has been developed that bind preferentially to a methylcytosine rather than the unmethylated counterpart. Based on molecular modeling calculation of interaction between a methylcytosine and zinc finger proteins, the novel artificial peptide containing phosphotyrosine has been synthesized. Structure of the peptide and binding ability toward methylated DNA was evaluated by NMR and gel mobility shift assay, respectively. Detection of methylation in duplex DNA was examined by fluorescent anisotropy using the fluorescent-labeled artificial peptide.
为了开发一种新的甲基化DNA检测方法，已经开发出一种优先与甲基胞霉素结合而不是未甲基化对应物的人造蛋白/肽。基于甲基胞嘧啶和锌指蛋白之间相互作用的分子建模计算，已经合成了含有磷酸酪氨酸的新型人工肽。 NMR和凝胶迁移率转移测定法分别评估了肽的结构和甲基化DNA的结合能力。使用荧光标记的人造肽通过荧光各向异性检查双链DNA中甲基化的检测。
项目成果
期刊论文数量（0）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Synthesis and characterization of zinc chelator conjugated with cationic peptide
阳离子肽锌螯合剂的合成与表征
- DOI：
- 发表时间：2011
- 期刊：
- 影响因子：2.4
- 作者：Yutaka Hitomi;Akihiro Kashida;Akiko Nomura;Masanori Hayashi;Masahito Kodera
- 通讯作者：Masahito Kodera
Detection of methylation status of DNA by designed phosphopeptide
通过设计的磷酸肽检测DNA甲基化状态
- DOI：
- 发表时间：2012
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：H. Tsunoda;T. Kudo;A. Ohkubo;K. Seio;M. Sekine;Akiko Nomura
- 通讯作者：Akiko Nomura
Recognition of methylcytosine in duplex DNA by artificial zinc finger peptide
人工锌指肽识别双链 DNA 中的甲基胞嘧啶
- DOI：
- 发表时间：2011
- 期刊：
- 影响因子：2.4
- 作者：Akiko Nomura;Akimitsu Okamoto
- 通讯作者：Akimitsu Okamoto
Discrimination between 5-hydroxy methylcytosine and 5-methylcytosine by a chemically designed peptide
通过化学设计的肽区分 5-羟甲基胞嘧啶和 5-甲基胞嘧啶
- DOI：10.1039/c1cc12131f
- 发表时间：2011
- 期刊：
- 影响因子：4.9
- 作者：Akiko Nomura;Kaori Sugizaki;Hiroyuki Yanagisawa;Akimitsu Okamoto
- 通讯作者：Akimitsu Okamoto
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Development of hemimethylated DNA recognition proteins for detection and control of DNA methylation
开发用于检测和控制 DNA 甲基化的半甲基化 DNA 识别蛋白
- 批准号：
24550198 - 财政年份：2012
- 资助金额：
$ 2.5万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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22659353 - 财政年份：2010
- 资助金额：
$ 2.5万 - 项目类别：
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- 批准号：
20390495 - 财政年份：2008
- 资助金额：
$ 2.5万 - 项目类别：
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20750144 - 财政年份：2008
- 资助金额：
$ 2.5万 - 项目类别：
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$ 2.5万 - 项目类别：
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- 批准号：
12557168 - 财政年份：2000
- 资助金额：
$ 2.5万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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- 批准号：
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- 资助金额：
$ 2.5万 - 项目类别：
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DNA羟甲基胞嘧啶分析方法的建立及胞嘧啶半修饰的生物学意义。
- 批准号：
21H02154 - 财政年份：2021
- 资助金额：
$ 2.5万 - 项目类别：
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21H02136 - 财政年份：2021
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$ 2.5万 - 项目类别：
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21K21205 - 财政年份：2021
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$ 2.5万 - 项目类别：
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鸟嘌呤和脱碱基位点DNA测序方法的开发
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18K05195 - 财政年份：2018
- 资助金额：
$ 2.5万 - 项目类别：
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