Detection and imaging of DNA methylation by artificial protein

人工蛋白检测DNA甲基化并成像

基本信息

项目摘要

To develop a new detection method of methylated DNA, an artificial protein/peptide has been developed that bind preferentially to a methylcytosine rather than the unmethylated counterpart. Based on molecular modeling calculation of interaction between a methylcytosine and zinc finger proteins, the novel artificial peptide containing phosphotyrosine has been synthesized. Structure of the peptide and binding ability toward methylated DNA was evaluated by NMR and gel mobility shift assay, respectively. Detection of methylation in duplex DNA was examined by fluorescent anisotropy using the fluorescent-labeled artificial peptide.
为了开发甲基化 DNA 的新检测方法，我们开发了一种人工蛋白质/肽，它优先与甲基胞嘧啶而不是未甲基化的对应物结合。基于甲基胞嘧啶与锌指蛋白相互作用的分子模型计算，合成了新型含磷酸酪氨酸的人工肽。分别通过NMR和凝胶迁移率测定评估了肽的结构和对甲基化DNA的结合能力。使用荧光标记的人工肽通过荧光各向异性检查双链 DNA 中甲基化的检测。

项目成果

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Synthesis and characterization of zinc chelator conjugated with cationic peptide
阳离子肽锌螯合剂的合成与表征
  • DOI：
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    Peptide Science
  • 影响因子：
    2.4
  • 作者：
    Yutaka Hitomi;Akihiro Kashida;Akiko Nomura;Masanori Hayashi;Masahito Kodera
  • 通讯作者：
    Masahito Kodera
Detection of methylation status of DNA by designed phosphopeptide
通过设计的磷酸肽检测DNA甲基化状态
  • DOI：
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    Peptide Science 2011
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    H. Tsunoda;T. Kudo;A. Ohkubo;K. Seio;M. Sekine;Akiko Nomura
  • 通讯作者：
    Akiko Nomura
Recognition of methylcytosine in duplex DNA by artificial zinc finger peptide
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  • DOI：
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    Peptide Sci
  • 影响因子：
    2.4
  • 作者：
    Akiko Nomura;Akimitsu Okamoto
  • 通讯作者：
    Akimitsu Okamoto
メチル化DNA結合ペプチド
甲基化DNA结合肽
  • DOI：
  • 发表时间：
    2009
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
  • 通讯作者：
Discrimination between 5-hydroxy methylcytosine and 5-methylcytosine by a chemically designed peptide
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  • DOI：
    10.1039/c1cc12131f
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    Chemical Communications
  • 影响因子：
    4.9
  • 作者：
    Akiko Nomura;Kaori Sugizaki;Hiroyuki Yanagisawa;Akimitsu Okamoto
  • 通讯作者：
    Akimitsu Okamoto
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