Structural study of translesion DNA polymeraseζ/REV1 complex

跨损伤 DNA 聚合酶 z/REV1 复合物的结构研究

• 批准号: 22770109
• 负责人: HASHIMOTO Hiroshi
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22770109/
• 关键词: X線結晶解析; DNA複製; DNA損傷; DNAポリメラーゼ; 損傷乘り越えDNA合成; 突然変異; 構造解析; タンパク質間相互作用; 損傷乗り越えDNA合成

REV1, REV3 and REV7 are pivotal proteins in translesion DNA synthesis that allows to continue DNA synthesis even in the presence of DNA damage. REV1 and REV3 are error-prone DNA polymerases. REV7 interacts with both polymerases, thereby acts as an adaptor protein that functionally links those polymerases. The ternary complex of the C-terminal domain of human REV1 in complex with REV7 bound to a REV3 fragment was successfully crystallized. The crystals belong to the space group of P3_121 with the cell-dimension of a=b=74.7, c=124.5 Å and・=120°. Electron density map obtained from molecular replacement method using REV7-REV3 complex as a search model clearly shows that the REV1 C-terminal domain adopts a four-helices bundle structure.

REV 1、REV 3和REV 7是跨损伤DNA合成中的关键蛋白，即使在存在DNA损伤的情况下也允许继续DNA合成。REV 1和REV 3是易错的DNA聚合酶。REV 7与这两种聚合酶相互作用，从而充当在功能上连接这些聚合酶的衔接蛋白。人REV 1的C-末端结构域与结合到REV 3片段的REV 7复合的三元复合物成功地结晶。晶体属P3_121空间群，晶胞参数a=B=74.7，c=124.5 °，·=120°。以REV 7-REV 3复合物为搜索模型的分子置换法得到的电子密度图清楚地表明，REV 1的C-末端结构域采用四螺旋束结构。

项目成果

Crystal structure of Nanos zinc-finger domain reveals functional implication of RNA-binding

Nanos 锌指结构域的晶体结构揭示了 RNA 结合的功能意义

• 发表时间: 2010
• 作者: H.Hashimoto;K.Hara;A.Hishiki;S.Kawaguchi;N.Shichijo;K.Nakamura;S.Unzai;Y.Tamaru;T.Shimizu;M.Sato
• 通讯作者: M.Sato

ニンジンEDGPによる麹菌XEGの阻害複合体構造

胡萝卜 EDGP 对曲霉菌 XEG 的抑制复合物结构

• 发表时间: 2011
• 作者: 吉澤拓也;橋本博;清水敏之;平野久;佐藤衛
• 通讯作者: 佐藤衛

Crystal Structure of Human REV7 in Complex with a Human REV3 Fragment and Structural Implication of the Interaction between DNA Polymerase ζ and REV1

• DOI: 10.1074/jbc.m109.092403
• 发表时间: 2010-04-16
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Hara, Kodai;Hashimoto, Hiroshi;Sato, Mamoru
• 通讯作者: Sato, Mamoru

損傷乗り越えDNA合成におけるタンパク質間相互作用の構造生物学

损伤幸存 DNA 合成中蛋白质-蛋白质相互作用的结构生物学

• 发表时间: 2010
• 作者: Y.Hayashi;et al.;橋本博
• 通讯作者: 橋本博

Structural Basis for Matrix Metalloproteinase-2 (MMP-2)-selective Inhibitory Action of β-Amyloid Precursor Protein-derived Inhibitor

• DOI: 10.1074/jbc.m111.264176
• 发表时间: 2011-09-23
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Hashimoto, Hiroshi;Takeuchi, Tomoka;Higashi, Shouichi
• 通讯作者: Higashi, Shouichi