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Development of algorithms for genome sequencing using next-generationDNA sequencers
使用下一代 DNA 测序仪开发基因组测序算法
基本信息
- 批准号：22700307
- 负责人：
- 金额：$ 2.5万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份：2010
- 资助国家：日本
- 起止时间：2010 至 2012
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
Genome sequencing using so-called next-generation DNA sequencers often results in rather fragmented sequences, and the positions of the fragmented sequences on chromosomes are usually unknown. We developed a system/algorithm that constructs a genetic map in a short time with less labor using next-generation DNA sequencers. Genetic maps generated by our algorithm can arrange fragmented sequences on chromosomes.
使用所谓的下一代DNA测序仪进行的基因组测序通常会产生相当片段化的序列，并且片段化序列在染色体上的位置通常是未知的。我们开发了一种系统/算法，可以使用下一代 DNA 测序仪在短时间内以更少的劳动力构建遗传图谱。我们的算法生成的遗传图谱可以在染色体上排列片段序列。
项目成果
期刊论文数量（0）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
YASRAT : Yet Another Short Read Alignment Tool
YASRAT：另一个短读对齐工具
- DOI：
- 发表时间：2011
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Zhuang;J.-C. and Jiang;Nagamitsu S.;Akito Taneda;Masahiro Kasahara
- 通讯作者：Masahiro Kasahara
Yet-Another Sequence Alignment Tool
另一种序列比对工具
- DOI：
- 发表时间：2010
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Masahiro Kasahara;YASRAT
- 通讯作者：YASRAT
Yet Another ShortRead AlignmentTool
另一种短读对齐工具
- DOI：
- 发表时间：2011
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Masahiro Kasahara;YASRAT
- 通讯作者：YASRAT
YASRAT : Yet-Another Sequence Alignment Tool
YASRAT：另一种序列比对工具
- DOI：
- 发表时间：2010
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Hamada;M.;Sato;K.;Asai;K.;Akito Taneda;Shikata K.;Araki Y;Masahiro Kasahara
- 通讯作者：Masahiro Kasahara
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