Informatische Methoden für Massenspektrometrie in der Genomik

基因组学中质谱的信息方法

基本信息

  • 批准号:
    5400926
  • 负责人:
  • 金额:
    --
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    德国
  • 项目类别:
    Independent Junior Research Groups
  • 财政年份:
    2003
  • 资助国家:
    德国
  • 起止时间:
    2002-12-31 至 2009-12-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Massenspektrometrie hat sich in den letzten Jahren zu einer der meistverwendeten Analysemethoden in der Proteomik entwickelt, und eine vergleichbare Entwicklung lässt sich zur Zeit im Bereich der Genomik erkennen. Die mathematischen und informatischen Probleme, die in diesem Kontext auftreten, sind vielfältiger Natur und reichen von der Signalverarbeitung über Approximationsprobleme bis hin zu sequenzbasierten Fragestellungen. Ziel des Projektes ist es, (bio-)informatische Methoden und Datenstrukturen zu entwickeln, die für die Auswertung von Massenspektren in der Genomik und Proteomik benötigt werden. Dabei werden voraussichtlich Methoden der Kombinatorik und Graphentheorie, Sequenzanalyse, Statistik und Datenbanken Verwendung finden. Ebenso finden sich Anknüpfungspunkte zur Phylogenetik, beispielsweise bei der Pathogentypisierung. Ein weiterer Schwerpunkt des Projektes soll darauf gelegt werden, dass neue sowie bekannte Verfahren und Algorithmen der Bioinformatik an ihrer Anwendbarkeit auf reale (und somit unvollständige oder vertauschte) massenspektrometrische Daten gemessen werden, und dass dadurch notwendinge Modifikationen der Modellierung und der Algorithmen vorgenommen und getestet werden.
这顶帽子是从工程中分析出来的,从现在开始就是这样,而现在这个时代是这样的。数学和信息的问题,死于文字的自动处理,从自然和现实中寻找解决问题的方法。在Genomik和Proteomik Benötigt中,Ziel des Projektes is es,(Bio-)Information atische Methoden and Datenstrukturen zu entwickeln,die für die Auswertung von MassenSpektren in der Genomik and Proteomik Benötigt wenden。我们用图论、序列分析、数理统计和数据分析等方法对此进行了研究。这是一种新的病原学诊断方法。生物信息学是一种更高层次的生物信息学和算法,它不仅适用于所有的生物信息学领域,而且也不适用于对生物信息学进行更多的修改。

项目成果

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