Development of genetic analysis method for risk diagnosis for multifactorial disease and drug response

开发多因素疾病风险诊断和药物反应的遗传分析方法

• 批准号: 22710191
• 负责人: NISHIDA Nao
• 金额: $ 2.25万
• 依托单位: Research Institute, International Medical Center of Japan
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22710191/
• 关键词: SNP; タイピング; 多因子疾患; 個別化医療

High-throughput and highly accurate SNP typing platforms are required to perform risk diagnosis for multifactorial disease and drug response. Here, we improve the DigiTag2 assay to shorten the running time and save the running cost by applying new type of enzyme. The DigiTag2 assay enables analysis of a set of 96 SNPs using Kapa 2GFast HotStart DNA polymerase with a new protocol that has a total running time of about 7 hours, which is 6 hours shorter than the previous protocol.

需要高通量和高准确度的SNP分型平台来进行多因素疾病和药物反应的风险诊断。本文对DigiTag2法进行了改进，采用新型酶，缩短了运行时间，节约了运行成本。DigiTag2检测能够使用Kapa 2GFast HotStart DNA聚合酶和新方案分析一组96个SNP，总运行时间约为7小时，比之前的方案缩短了6小时。

项目成果

Identification of novel schizophrenia loci by homozygosity mapping using DNA microarray analysis.

• DOI: 10.1371/journal.pone.0020589
• 发表时间: 2011
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Kurotaki N;Tasaki S;Mishima H;Ono S;Imamura A;Kikuchi T;Nishida N;Tokunaga K;Yoshiura K;Ozawa H
• 通讯作者: Ozawa H

C型慢性肝炎に対するペグインターフェロン+リバビリン併用療法の有効性を規定するホスト側遺伝要因の同定

确定决定聚乙二醇干扰素+利巴韦林联合治疗慢性丙型肝炎有效性的宿主遗传因素

• 发表时间: 2010
• 作者: Morito D.;Nishikawa K.;(10名省略);Nagata K.;西田奈央,田中靖人,杉山真也,小池麻子,提嶋恵美,小笠原有子,石橋良美,柴田靖加,溝上雅史,徳永勝士
• 通讯作者: 西田奈央,田中靖人,杉山真也,小池麻子,提嶋恵美,小笠原有子,石橋良美,柴田靖加,溝上雅史,徳永勝士

A genome-wide association study identifies the ass ociation of HLA-DP locus with chro nic hepatitis B and viral clearance

全基因组关联研究确定了 HLA-DP 位点与慢性乙型肝炎和病毒清除的关联

• 发表时间: 2011
• 作者: Nishida N;Sawai H;Mawatari Y;Y amaoka M;Koike A;Matsuura K;T anaka Y;Sugiyama M;Ito K;Mizok ami M;Tokunaga K
• 通讯作者: Tokunaga K

A genome-wide association study identifies the association of HLA-DP locus with chronic hepatitis B and viral clearance

全基因组关联研究确定了 HLA-DP 位点与慢性乙型肝炎和病毒清除的关联

• 发表时间: 2011
• 作者: Nao Nishida;Hiromi Sawai;Yoriko Mawatari;Megumi Yamaoka;Asako Koike;Kentaro Matsuura;Yasuhito Tanaka;Masaya Sugiyama;Kiyoaki Ito;Masashi Mizokami;Katsushi Tokunaga
• 通讯作者: Katsushi Tokunaga

Comparative analysis of copy number variation detection methods and database construction

• DOI: 10.1186/1471-2156-12-29
• 发表时间: 2011-03-07
• 期刊: BMC GENETICS
• 影响因子: 2.9
• 作者: Koike, Asako;Nishida, Nao;Tokunaga, Katsushi
• 通讯作者: Tokunaga, Katsushi