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Chloroplast phylogenomics to resolve the phylogenetic relationships of major taxonomic groups in bryophytes

叶绿体系统发育学解析苔藓植物主要分类群的系统发育关系

基本信息

批准号：
23370045
负责人：
DEGUCHI Hironori
金额：
$ 11.9万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011-04-01 至 2014-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23370045/
关键词：
コケ植物葉緑体ゲノム分子系統分類進化系統分類学

项目摘要

Chloroplast genomes of seven mosses, two liverworts and one hornworts species were newly sequenced. Comparison of the chloroplast genomes showed that T. lepidozioides had the largest cp genome in the mosses and the gene content was almost identical to those of liverworts and hornworts. Some gene-loss events through the evolution were indicated to be effective for considering the relationships of major moss lineages.In addition, we firstly detected linear and circular DNA molecules of chloroplast genome in a Sphagnum moss. Some larger molecules seem to be derived from multimeric conformations of single genomes. The occurrence of linear and multimeric molecules also have been known in some flowering plants. Such structural plasticity of the chloroplast genome seems to be evolutionary conserved across land plants.

对7种藓类、2种苔类和1种角苔类植物的叶绿体基因组进行了新测序。叶绿体基因组比较表明，鳞翅目的cp基因组在苔藓中最多，其基因含量与苔类和角类几乎相同。进化过程中的一些基因丢失事件被认为是考虑苔藓主要系间关系的有效因素。此外，我们首次在苔藓中检测到叶绿体基因组的线状和环状DNA分子。一些较大的分子似乎来自于单个基因组的多聚构象。在一些开花植物中也发现了线形分子和多聚体分子。叶绿体基因组的这种结构可塑性似乎在陆地植物中具有进化保守性。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

セン類イシヅチゴケの葉緑体ゲノム構造

苔藓的叶绿体基因组结构

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
Tsubamoto;T.;Egi;N.;Takai;M.;Thaung-Htike;Zin-Maung-Maung-Thein;定光淳・嶋村正樹・榊原恵子・山口登美夫・出口博則
通讯作者：
定光淳・嶋村正樹・榊原恵子・山口登美夫・出口博則

Chloroplast genome sequencing of the moss, Andreaea nivalis

苔藓 Andreaea nivalis 的叶绿体基因组测序

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kosugi;I.;Shimamura;M.;Yamaguchi;T.;Deguchi;H.
通讯作者：
H.

葉緑体遺伝子大規模データセットに基づくセン類の分子系統解析

基于大规模叶绿体基因数据集的Senae分子系统发育分析

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
長野由梨子;長濱統彦;小西正朗; 森梢; 嶋根康広;大田ゆかり;秦田勇二;定光淳・坪田博美*・嶋村正樹・榊原恵子・山口登美夫・出口博則
通讯作者：
定光淳・坪田博美*・嶋村正樹・榊原恵子・山口登美夫・出口博則

The complete chloroplast genome sequences of four early divergent mosses: Takakia lepidozioides (Takakiopsida), Sphagnum palustre (Sphagnopsida), Andreaea nivalis (Andreaeopsida) and Oedipodium griffithianum (Oedpodiopsida).

四种早期分化苔藓植物的完整叶绿体基因组序列：Takakia lepidozioides (Takakiopsida)、Sphagnum palustre (Sphagnopsida)、Andreaea nivalis (Andreaeopsida) 和 Oedipodium griffithianum (Oedpodiopsida)。