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RNAエディティングによるゲノム情報の変換システム-葉緑体ゲノムでの解析-

RNAエディティングによるゲノム情報の変換システム-葉緑体ゲノムでの解析-
使用RNA编辑的基因组信息转换系统 - 叶绿体基因组分析 -
批准号：
15011101
负责人：
杉浦 昌弘
金额：
$3.84万
依托单位：
Nagoya City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2003 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15011101/
关键词：
RNAエディティングタバコ葉緑体in vitro系mRNAシス配列トランス因子

项目摘要

项目成果

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色素体は、原色素体(種子)からエチオプラスト(芽生え)、葉緑体(葉)、クロモプラスト(果実)などへと形態的にも、機能的に大きく変化する。陸上植物の葉緑体ゲノムからの転写産物は、RNAエディティング(C→U)によりDNAの一次情報が一部変換するため、ゲノム情報の正確な解読にはRNAエディティングの網羅的知見が必須である。そこで、タバコを用いて以下の3点の研究を行った。1.RNAエディティングのシス配列の同定以前に開発した「in vitro RNAエディティング系」はP32標識基質を用いるため煩雑であった。そこで、簡素化のため、蛍光標識ダイデオキシヌクレオチドとプライマー伸長法を組み合わせた新しい活性測定法の開発に成功した。この手法ではP32標識基質の作製が困難なmRNAにも対応可能である。2.RNAエディティングのトランス因子の同定と単離既に、4種のエディティング部位のトランス因子を同定したが、そのうちでin vitro活性の最も高いpsbE mRNAエディティングに対する56kDaのトランス因子の単離を進めた。タバコ緑葉10kg相当より葉緑体を単離し、硫安分画法とゲル濾過法でin vitroエディティング活性を指標に精製を行いほぼ単一のタンパク質を得た。3.RNAエディティングの進化システムの考察栽培タバコ(Nicotiana tabacum,4n)は、祖先種のN.sylvestris(2n)とN.tomentosiformis(2n)が融合してできた異質4倍体である。RNAエディティングの起源と進化を調べるため、上記3種のエディティング部位をさらに同定する必要がある。そのため、タバコ祖先種2種の葉緑体DNAの全塩基配列を、ショットガン法で決定した。
期刊论文(14)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Sugiura, M.: "History of chloroplast genomics"Photosynthesis Research. 76. 371-377 (2003)
Sugiura, M.：“叶绿体基因组学的历史”光合作用研究。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Cloix, C.: "In vitro analysis of sequences required for transcription of the Arabidopsis thaliana 5S rRNA genes"Plant Journal. 35. 251-261 (2003)
Cloix, C.：“拟南芥 5S rRNA 基因转录所需序列的体外分析”《植物杂志》。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Hasegawa, K.: "A tRNA^<Lew>-like sequence located immediately upstream of an Arabidopsis clock-regulated gene is transcriptionally active"Gene. 307. 133-139 (2003)
Hasekawa, K.：“位于拟南芥时钟调节基因上游的 tRNA^<Lew> 样序列具有转录活性”基因。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Miyamoto, T.: "A site-specific factor interacts directly with its cognate RNA editing site in chloroplast transcripts"Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 101. 48-52 (2004)
Miyamoto, T.：“位点特异性因子直接与其叶绿体转录本中的同源 RNA 编辑位点相互作用”Proc.Natl.Acad.Sci.USA。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 7 条
    葉緑体から核への遺伝子移行を説明する翻訳不適合説の実験的検証
    • 批准号：
      19657072
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $1.86万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      杉浦 昌弘
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    RNAエディティングによるゲノム情報の変換システム - 葉緑体ゲノムでの網羅的解析
    • 批准号：
      16011251
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $4.16万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      杉浦 昌弘
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    植物in vitro RNAスプライシング系の開発
    • 批准号：
      16657017
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $1.79万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      杉浦 昌弘
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    RNAエディティングによる遺伝情報の変換システム―葉緑体ゲノムでの網羅的解析
    • 批准号：
      14011101
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.9万
    • 财政年份：
      2002
    • 负责人：
      杉浦 昌弘
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    海外基金