RNAエディティングによるDNAゲノム情報の変換-葉緑体ゲノムでの網羅的解析

RNA编辑转换DNA基因组信息——叶绿体基因组综合分析

• 批准号: 13201001
• 负责人: 杉浦 昌弘
• 金额: $ 4.29万
• 依托单位: Nagoya City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13201001/
• 关键词: RNAエディティング; タバコ; 葉緑体; エンドウ; in vitro系; mRNA; シス配列; トランス因子

葉緑体はその発生プログラムにより原色素体(種子)からエチオプラスト(芽生え)、葉緑体(葉)、クロモプラスト(果実)などへと形態的・機能的に大きく変化する。高等植物の葉緑体ゲノムからの転写産物は、RNAエディティング(C→U)によりDNAの一次情報が一部変換するため、ゲノム情報の正確な解読にはRNAエディティングの網羅的知見が必須である。そこで最も研究の進んでいる、タバコ葉緑体を用いて以下の解析を進めている。1)RNAエディティング部位の網羅的同定組織的なRNAエディティング部位の探索のため、タンパク質コード領域とそれ以外の転写領域を調べる必要がある。新たにrps2 mRNAに部位を発見した。ついで、エンドウ葉緑体でも調査を開始し、8ケ所の部位を同定した。2)RNAエディティングのシス配列とトランス因子の同定タバコ単離葉緑体より開発したin vitro RNAエディティング系を用いて、タバコ葉緑体psbE mRNAとpetB mRNAのシス配列を同定し、合わせて両者のトランス因子の同定も行った。

Chloroplast development is the process of protochromes (seeds), germination, chloroplasts (leaves), fruit development, morphological and functional development. The chloroplast of higher plants is composed of DNA, RNA, DNA (C→U), DNA and DNA. The analysis of chloroplasts in the following fields is carried out. 1)RNA A new rps2 mRNA site was identified. The chloroplasts were investigated at the beginning and at the same time at the site. 2)RNA sequence alignment and transcription factors development in vitro RNA sequence alignment and transcription factors development in vitro chloroplast psbE mRNA and petB mRNA sequence alignment.

项目成果

Arnaud, P.: "Analysis of the SINE S1 Pol III promoter from Brassica"Plant Journal. 26. 295-305 (2001)

Arnaud, P.：“来自芸苔属的 SINE S1 Pol III 启动子的分析”植物杂志。

Yukawa, Y.: "A tobacco nuclear extract supporting transcription,processing,splicing and modification from plant intron-containing tRNA precursors"Plant Journal. 28. 583-594 (2001)

Yukawa, Y.：“一种支持植物内含子 tRNA 前体转录、加工、剪接和修饰的烟草核提取物”《植物杂志》。

Nakamura T.: "Chloroplast ribonucleoproteins function as a stabilizing factor of ribosomefree mRNAs in the stroma."J.Biol.Chem.. 276. 147-152 (2001)

Nakamura T.：“叶绿体核糖核蛋白作为基质中无核糖体 mRNA 的稳定因子发挥作用。”J.Biol.Chem.. 276. 147-152 (2001)

Hirose, T.: "Involvement of a site-specific trans-acting factor and a common RNA-binding protein in the editing of chloroplast mRNAs"EMBO J.. 20. 1144-1152 (2001)

Hirose, T.：“位点特异性反式作用因子和常见 RNA 结合蛋白参与叶绿体 mRNA 的编辑”EMBO J.. 20. 1144-1152 (2001)

Tsudzuki, T.: "Comparative analysis of RNA editing sites in higher plant chloroplasts"J. Mol. Evol.. 53. 327-332 (2001)

Tsudzuki, T.：“高等植物叶绿体中 RNA 编辑位点的比较分析”J.