Comprehensive identification of abnormally spliced RNAs and elucidation of their significance

全面鉴定异常剪接的RNA并阐明其意义

• 批准号: 23510234
• 负责人: SAKAMOTO Hiroshi
• 金额: $ 3.49万
• 依托单位: Kobe University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23510234/
• 关键词: mRNA品質管理; 生殖細胞; エキソン連結部複合体; 細胞質スプライシング; 線虫; 異常スプライシング; 性決定遺伝子; RNA品質管理; 遺伝子; 核酸; ゲノム; 発現制御; 性決定

In Y14(RNAi) and mag-1(RNAi) animals, unspliced tra-2 RNA is leaked to the cytoplasm and unusually spliced to tra-2s RNA by the cytoplasmic splicing enzyme IRE-1. The protein produced from tra-2s RNA acts dominant-negatively against normal TRA-2 protein because transgenic animals expressing TRA-2s protein showed germline masculinization like Y14(RNAi) animals. Interestingly, the leakage of unspliced RNA caused by the inhibition of Y14 or MAG-1 was also observed for almost all genes examined so far. Moreover, inhibition of eIF4AIII and SAP130 also caused leakage of unspliced RNA to the cytoplasm. Double RNAi analysis indicated that Y14 interacts with both SAP130 and two other splicing-related factors. These results suggest that the EJC core subunits associate with pre-mRNA and function as the gatekeeper to watch and block premature export of unspliced RNA, thereby contributing to mRNA quality control in C. elegans.

在Y14（RNAi）和mag-1（RNAi）动物中，未剪接的tra-2 RNA泄漏到细胞质中，并通过细胞质剪接酶IRE-1异常地剪接为tra-2s RNA。从tra-2s RNA产生的蛋白质对正常TRA-2蛋白质起显性负作用，因为表达TRA-2s蛋白质的转基因动物显示像Y14（RNAi）动物的生殖系雄性化。有趣的是，迄今为止，在几乎所有检测的基因中也观察到由Y14或MAG-1的抑制引起的未剪接RNA的泄漏。此外，eIF 4AIII和SAP 130的抑制也导致未剪接的RNA泄漏到细胞质中。双RNAi分析表明，Y14与SAP 130和其他两个剪接相关因子相互作用。这些结果表明，EJC核心亚基与前mRNA相关，并作为看门人监视和阻止未剪接RNA的过早输出，从而有助于C.优雅的

项目成果

A specific set of EJC subunits is required for the nuclear retention of unspliced RNAs in C. elegans

秀丽隐杆线虫中未剪接 RNA 的核保留需要一组特定的 EJC 亚基

• DOI: 10.1128/mcb.01298-12
• 发表时间: 2013
• 期刊: Molecular and Cellular Biology
• 影响因子: 5.3
• 作者: Masami Shiimori;KunioInoue;Hiroshi Sakamoto
• 通讯作者: Hiroshi Sakamoto

線虫C.elegansにおける生殖細胞形成に関与するクロマチンリモデリング因子群の局在機構の解析

线虫生殖细胞形成中染色质重塑因子的定位机制分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 巳波孝至;高崎輝恒;井上邦夫;坂本博
• 通讯作者: 坂本博

線虫C.elegansにおける生殖細胞形成に関与するクロモドメインタンパクMRG-1の局在機構の解析

线虫生殖细胞形成中染色质结构域蛋白MRG-1的定位机制分析

• 发表时间: 2014
• 作者: 巳波孝至;高崎輝恒;坂本博
• 通讯作者: 坂本博

MRG-1 acts as an epigenome interpreter of Lys36 methylation on histone H3

MRG-1 充当组蛋白 H3 上 Lys36 甲基化的表观基因组解释者

• 发表时间: 2013
• 作者: Teruaki Takasaki;Thea Egelhofer;Andreas Rechtsteiner;Hiroshi Sakamoto;Susan Strome
• 通讯作者: Susan Strome

線虫 EJC 中核因子 Y14はスプライシング未完了 RNA の核外輸送を防ぐ

秀丽隐杆线虫EJC核心因子Y14阻止未剪接RNA的核输出

• 发表时间: 2012
• 作者: 椎森仁美;井上邦夫;坂本博
• 通讯作者: 坂本博