Identification of the novel genes associated with vascular morphogenesis

与血管形态发生相关的新基因的鉴定

• 批准号: 23590222
• 负责人: KIMURA Eiji
• 金额: $ 3.24万
• 依托单位: Iwate Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23590222/
• 关键词: 血管形成; ゼブラフィッシュ; マイクロアレイ; etsrp/etv2; 血管芽細胞; 形態形成; 分化; 脈管形成; 血管新生; ETSrp

Vascular formation progressed with a regular time course to form a uniform structure. However the associated genes of vascular morphogenesis are still poorly uncovered. To address this issue, we performed microarray analysis of etsrp/etv2 deficient zebrafish embryos. As a result, we identified 165 genes that were up-regulated greater than 1.5 fold by silencing etsrp/etv2 expression. Furthermore, we analyzed their expression patterns to evaluate whether these genes were associated with the cranial and/or truncal vascular formation by in silico analysis using ZFIN database, and selected 11 genes which were expressed in the specific region associated with the vascular formation. We also performed in situ hybridization for 68 selected genes which precise expression patterns were not obtained, and succeeded to demonstrate three new expression patterns. We are now planning to knock out these genes using CRISPR/Cas9 system to analyze their function for the vascular formation.

血管形成以规律的时间进程进行，以形成均匀的结构。然而，与血管形态发生相关的基因仍然很少被发现。为了解决这个问题，我们进行了etsrp/etv 2缺陷斑马鱼胚胎的微阵列分析。结果，我们鉴定了165个通过沉默etsrp/etv 2表达而上调超过1.5倍的基因。此外，我们分析了它们的表达模式，以评估这些基因是否与颅和/或躯干血管形成的计算机分析使用ZFIN数据库，并选择了11个基因，表达在特定区域与血管形成。我们还对68个未获得精确表达模式的基因进行了原位杂交，并成功地证明了三种新的表达模式。我们现在计划使用CRISPR/Cas9系统敲除这些基因，以分析它们在血管形成中的功能。

项目成果

脳血管の脈管形成と血管新生のライブイメージング

脑血管发生和血管生成的实时成像

• 发表时间: 2012
• 作者: 木村英二;磯貝純夫;齊藤絵里奈;人見次郎
• 通讯作者: 人見次郎

内頚動脈系と椎骨動脈系は発生過程においていかにして連結されるのか

颈内动脉系统和椎动脉系统在发育过程中是如何连接的？

• 发表时间: 2013
• 作者: 木村英二;磯貝純夫;人見次郎
• 通讯作者: 人見次郎

New anatomical findings in the cranial vascular development of the zebrafish.

斑马鱼颅血管发育的新解剖学发现。

• 发表时间: 2013
• 作者: Hitomi J;Isogai S;Kimura E
• 通讯作者: Kimura E

Application of Infrared Laser to the Zebrafish Vascular System Gene Induction, Tracing, and Ablation of Single Endothelial Cells

• DOI: 10.1161/atvbaha.112.300602
• 发表时间: 2013-06-01
• 期刊: ARTERIOSCLEROSIS THROMBOSIS AND VASCULAR BIOLOGY
• 影响因子: 8.7
• 作者: Kimura, Eiji;Deguchi, Tomonori;Hitomi, Jiro
• 通讯作者: Hitomi, Jiro

In vivo gene manipulation in the targeted single cells using an infrared laser.

使用红外激光对目标单细胞进行体内基因操作。

• 发表时间: 2014
• 作者: Eiji Kimura;Yasuhiro Kamei
• 通讯作者: Yasuhiro Kamei