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日本－韓国に分布するアブラムシ類の地理的起源の探究と新たな遺伝マーカーの開発

探索分布在日本和韩国之间的蚜虫的地理起源并开发新的遗传标记

基本信息

批准号：
11F01079
负责人：
秋元信一
金额：
$ 1.02万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2012
项目状态：
已结题

项目摘要

平成24年度には、韓国と日本の双方から採集された材料を用いて、アブラムシグループの系統樹の構築を進めた。エンドウヒゲナガアブラムシおよびソラマメヒゲナガアブラムシの双方についてミトコンドリア遺伝子のCOI領域を用いて系統樹構築を進めたところ、どちらの種に関しても、日本国内での寄主植物間の分化が大きく、日本と韓国の集団間で大きな分断が生じた傾向は見いだせなかった。これらの事実は、日本-韓国の地史的分断(15万年前と推定されている)は、遺伝子配列に大きな影響を及ぼしてしていないことがあらためて確認できた。平成24年度は、DNAバーコーディングを効率よく進めるために遺伝子マーカーの探索にも取り組み、成果を上げることが出来た。DNAバーコーディング研究において一般的に用いられるミトコンドリアCOI領域では、近縁種を区別出来ない事例が数多く報告されており、そこで、この欠点を補えるようなマーカー領域の開発が求められていた。種を効率良く識別するバーコーディング領域の必要十分な特性として、種内では変異を示さず、種間で大きな変異が認められるようなマーカー領域を用いることが望ましい。本研究では、遺伝子データベースに基づいて11遺伝子の種間・種内での多様性を調べ挙げ、バーコーディング遺伝子候補として2遺伝子に絞った。さらにこの結果に基づいて、22種からなる33個体を用いてDNAを抽出し、個体間の多様性を調べた。この結果、ミトコンドリアのATP8遺伝子領域が最も遺伝子バーコーディングに適していることが明らかとなった。

In 2004, the construction of phylogenetic trees was carried out in Korea and Japan. In addition, the host plants in Japan and South Korea have a tendency to differentiate between host plants. The division of the history of Japan and Korea (150,000 years ago) has been greatly influenced by the arrangement of the descendants. In 2014, the company launched a series of research projects to improve the quality of its products. A number of cases were identified in the field of COI, and a large number of reports were submitted. The necessary characteristics of the field are: intraspecies, and intraspecies. In this study, the genetic diversity of 11 species and 12 species was investigated. In addition, 22 species of DNA were extracted from 33 individuals, and diversity among individuals was modulated. As a result, the ATP8 gene domain is the most important gene domain.