タンパク質-配位子相互作用の光反応過程直接観測
タンパク質-配位子相互作用の光反応過程直接観測
批准号:
11J10227
负责人:
富田 文菜
金额:
$1.54万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2011
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2011 至 2013
中文摘要
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英文摘要
平成25年度は、24年度に引き続き、一酸化炭素結合型ヘモグロビンの時間分解X線回折実験を行い、配位子の解離に伴う分子変形の過程を明らかにするため、室温付近でのポンプ-プロープ実験を行った。室温付近でのX線照射による試料のダメージを考慮すると、データセット当たりの回折イメージ数が抑えられる、白色X線での測定が適しているため、Laue法での測定を行った。配位子の解離効率を上げるため、アロステリックエフェクターを付加したヘモグロビンを測定試料とし、その一酸化炭素結合型ヘモグロビン単結晶の作製は、自治医科大学の生物物理学部門の研究室の設備を使用して行った。時間分解ポンプ-プローブ実験については、高エネルギー加速器研究機構のPF-AR/NW14Aにて行った。また、試料結晶をマウントする際の雰囲気制御等を行い、室温付近での試料の固定方法を改善した。その結果、現時点でレーザー照射前後での差電子マップの生成までを行う事ができた。他に、低温下のアロステリックエフェクター付きのヘモグロビンでは、時間とともに光解離した配位子がヘモグロビン分子内部の空洞にトラップされる様子が観測された。また、配位子の移動に伴うアミノ酸残基の原子位置のシフトについても観測することができた。また、同様の測定条件下において顕微分光実験を行い、光解離率を見積もることができた。現在この結果について、論文を執筆中である。これまでに得られたHbA、HbC、BzfHbCOの配位子光解離実験の結果については、2014年3月に行われた物構研サイエンスフェスタ2013にてポスター発表を行った。今後、アロステリックエフェクターを付加したヘモグロビンのラウエ回折実験の結果についても、継続的に成果発表を行う予定である。
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Ligand migration in myoglobin : A combined study of computer simulation and x-ray crystallography
肌红蛋白中的配体迁移:计算机模拟和 X 射线晶体学的综合研究
DOI:
10.1063/1.4704586
发表时间:
2012
期刊:
The Journal of Chemical Physics
影响因子:
--
作者:
[Takayuki Tsuduki, Ayana Tomita, Shin-ya Koshihara, Shin-ichi Adachi, Takahisa Yamato]
通讯作者:
Takahisa Yamato
Slow Ligand Migration Dynamics in Human Hemoglobin at Cryogenic Temperature
低温下人体血红蛋白的缓慢配体迁移动力学
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tokushi Sato, Shunsuke Nozawa, Ayana Tomita, Manabu Hoshino, Shin-ya Koshihara and Shin-ichi Adachi, 富田文菜, 富田文菜]
通讯作者:
富田文菜
Slow Ligand Migration Dynamics in Tetrameric Hemoglobin at Cryogenic Temperature
低温下四聚体血红蛋白的缓慢配体迁移动力学
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[富田文菜, 佐藤篤志, 野澤俊介, 星野学, 野口大貴, 朴三用, 柴山修哉, 腰原伸也, 足立伸一]
通讯作者:
足立伸一
Time-resolved X-ray crystal structure analysis for elucidating the hidden 'over-neutralized' phase of TTF-CA
时间分辨 X 射线晶体结构分析,用于阐明 TTF-CA 隐藏的“过度中和”相
DOI:
10.1039/c3ra42489h
发表时间:
2013
期刊:
Royal Society of Chemistry Advances
影响因子:
--
作者:
[Manabu Hoshino, Shunsuke Nozawa, Tokushi Sato, Ayana Tomita, Shinichi Adachi and Shin-ya Koshihara]
通讯作者:
Shinichi Adachi and Shin-ya Koshihara
Time-resolved X-ray liquidography for applying XFEL
应用 XFEL 的时间分辨 X 射线液相术
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tokushi Sato, Shunsuke Nozawa, Ayana Tomita, Manabu Hoshino, Shin-ya Koshihara and Shin-ichi Adachi]
通讯作者:
Shin-ya Koshihara and Shin-ichi Adachi
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