ラマン光学活性と量子力学・分子動力学計算による溶液中タンパク質の柔軟構造の解析
ラマン光学活性と量子力学・分子動力学計算による溶液中タンパク質の柔軟構造の解析
批准号:
12J00014
负责人:
山本 茂樹
金额:
$0.77万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2012
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2012 至 2014
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自然状態で解けた構造を持つタンパク質、アミロイド繊維およびその中間体、会合を行うタンパク質は様々な疾患との関連性が指摘されており、それらタンパク質の詳細な構造解析を行うことはそれらタンパク質の機能と性質を理解する上で非常に重要である。ラマン光学活性(ROA)分光法は分子構造に極めて鋭敏であり、かつラマン散乱という非常に速い現象に基づいている為、速い構造平衡にある分子であっても、スペクトルの量子力学計算と組み合わせることで、その柔軟構造と構造存在比を詳細に解析できる分光分析法であり、従来の分析法では解析の難しいタンパク質の構造を知る上で本研究の必要性は高い。現行のROA装置の欠点は、測定時間が長いこと、また試料量が多いことである。これらの点を解決できれば、ROA測定をより一般的な構造分析法とすることができ、これまで測定の難しかった希少なタンパク質、キラル分子を測定可能となる。測定時間を劇的に減少させることで、タンパク質の変性過程をより詳細に追跡し、中間体構造の数と構造変化過程を追跡できる。本年度は、世界最高の感度を持つROA測定装置を目指し、設計を行い、装置製作に着手した。この装置は、独創的な光学系を有しており、ラマン散乱光の検出効率については既存のROA装置を越える性能を持っている。今後さらに装置改良を行い装置誤差の削減を行えば、世界の注目を集める研究になることと思われる。また、インスリンアミロイド線維の高次構造をROA分光の実験スペクトルと量子力学/分子動力学計算から解析する研究に着手した。βヘリックスおよびβロールの二つの三次構造に類似したインスリンモデルを作製し、モデルの妥当性を検証した。アミロイド線維の高次構造が詳細に決定できれば、アミロイド線維の自然化過程の分子的機構についての新たな重要な知見が得られると思われる。
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Intermolecular vibrational bands of poly-(R)-3-hydroxybutylate observed in a THz region
在太赫兹区域观察到的聚(R)-3-羟基丁酸酯的分子间振动带
DOI:
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发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hosseini, R., 山本茂樹, 山本茂樹, 山本茂樹]
通讯作者:
山本茂樹
低波数ラマン分光と量子化学計算による高分子の振動解析
使用低波数拉曼光谱和量子化学计算对聚合物进行振动分析
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[T. Sasaki, T. Naito, and H. Fujishiro, 山本 茂樹・森澤 勇介・保科 宏道・佐藤 春実・尾崎 幸洋]
通讯作者:
山本 茂樹・森澤 勇介・保科 宏道・佐藤 春実・尾崎 幸洋
ラマン光学活性による溶液中タンパク質の構造解析法の開発
利用拉曼光学活性开发溶液中蛋白质的结构分析方法
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[黒川恵史, 中塚憲章, 柳楽知也, 吉矢真人, 安田秀幸, 山本茂樹]
通讯作者:
山本茂樹
Structures of Native Insulin and its Amyloid Fibril Explored by Raman Optical Activity
通过拉曼光学活性探索天然胰岛素及其淀粉样原纤维的结构
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Heianza Y, Arase Y, Kodama S, Hsieh SD, Tsuji H, Saito K, Shimano H, Hara S, Sone H., 山本茂樹]
通讯作者:
山本茂樹
Solution Structures of Peptide and Protein Explored by Raman Optical Activity
利用拉曼光学活性探索肽和蛋白质的溶液结构
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Heianza Y, Arase Y; Saito K, Tsuji H, Fujihara K, Hsieh SD, Kodama S, Shimano H, YamadaN, Hara S, Sone H, 山本茂樹]
通讯作者:
山本茂樹
共 6 条
誘起円偏光発光とニューラルネットワーク法によるキラル分子の構造解析
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批准号:22K05152
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2022
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负责人:山本 茂樹
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依托单位:
希土類錯体のラマン光学活性を用いたμM濃度キラル分子の光学純度決定
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批准号:25888015
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项目类别:Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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资助金额:$1.75万
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财政年份:2013
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负责人:山本 茂樹
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依托单位:
希土類錯体のラマン光学活性を用いたμM濃度キラルアルコールの光学純度決定
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批准号:24750076
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2012
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负责人:山本 茂樹
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依托单位:
表面増強ラマン散乱法の液液界面ナノマッピングとキラル計測への展開
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批准号:05J09906
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.73万
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财政年份:2005
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负责人:山本 茂樹
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依托单位:
海外基金