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Ab initio Molecular Dynamics Studies of Aspects of the "Iron-Sulfur World Scenario"

Ab initio Molecular Dynamics Studies of Aspects of the "Iron-Sulfur World Scenario"
“铁硫世界情景”各方面的从头算分子动力学研究
批准号:
5412430
负责人:
Professor Dr. Dominik Marx
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2003
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2002-12-31 至 2012-12-31

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项目成果

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Mittels Car-Parrinello Molekulardynamik sollen einige Aspekte des so genannten "Eisen-Schwefel-Welt Szenarios" untersucht werden, einer der faszinierendsten und innovativsten Theorien zur Entstehung des Lebens auf der Erde. Wässrige Lösungen unter hohem Druck und bei hoher Temperatur, zusammen mit Eisensulfidoberflächen, sind hier notwendige Voraussetzungen für die vorbiologische Chemie. Ein entscheidender Schritt der vorgeschlagenen Reaktionsfolge, nämlich die Synthese von Polyglycin an der Pyrit-Wasser Phasengrenze unter extremen p/T Bedingungen, soll mit ab initio MD simuliert werden. Fragestellungen in diesem Zusammenhang betreffen die Adsorption von Glycin, den Reaktionsmechanismus und den Einfluss von Defekten in Gegenwart von heißem komprimiertem Wasser. Ein wichtiges Argument für das "Eisen-Schwefel-Welt Szenario" ist die Tatsache, dass Fe-S Komplexe die reaktiven Zentren von vielen Enzymen bilden, was möglicherweise ein Erbe der vorbiologischen Chemie ist. Daher werden wir in einem zweiten Zweig dieses Projektes solche Komplexe, eingebettet in eine Biomatrix, untersuchen. Zur näherungsweisen Beschreibung ihrer magnetischen Eigenschaften in einer dynamischen Simulation schlagen wir eine Implementierung des "Broken Symmetry" Ansatzes vor. Ähnlich wie die vor kurzem in unserer Gruppe entwickelte nichtadiabatische Dynamik basiert auch diese Methode auf der gleichzeitigen Propagation zweier elektronischer Zustände.
期刊论文(1)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Constrained spin-density dynamics of an iron-sulfur complex: ferredoxin cofactor.
铁硫复合物的约束自旋密度动力学:铁氧还蛋白辅助因子
DOI: 10.1063/1.4722552
发表时间: 2012
期刊: The Journal of chemical physics
影响因子: --
作者: [Md. E. Ali, N. N. Nair, V. Staemmler, D. Marx]
通讯作者: D. Marx
Assessing the Impact of Tagging Species on the Fluxional Behavior of Protonated Methane
  • 批准号:
    409795857
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2018
  • 负责人:
    Professor Dr. Dominik Marx
  • 依托单位:
Collective Proton Tunneling in Ice?
  • 批准号:
    238570623
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2013
  • 负责人:
    Professor Dr. Dominik Marx
  • 依托单位:
Understanding Enzymatic Hydrolysis Mechanisms using Computer Simulations
  • 批准号:
    226972182
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2013
  • 负责人:
    Professor Dr. Dominik Marx
  • 依托单位:
From compatible solutes to ribozymes at HHP conditions
  • 批准号:
    243203486
  • 项目类别:
    Research Units
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2013
  • 负责人:
    Professor Dr. Dominik Marx
  • 依托单位:
国内基金
海外基金
微溶剂效应对 SN2 反应动力学的影响:直接 ab initio 轨线研究
  • 批准号:
    21573052
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    66.0万元
  • 批准年份:
    2015
  • 负责人:
    张家旭
  • 依托单位:
有限核对关联和微观对相互作用的研究
  • 批准号:
    11075213
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    30.0万元
  • 批准年份:
    2010
  • 负责人:
    田源
  • 依托单位: