Comparison of genomic and epigenomicexpression in monozygotic twins using next-generation sequencing.

使用下一代测序比较同卵双胞胎的基因组和表观基因组表达。

• 批准号: 23659519
• 负责人: KUBOTA Takeo
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: University of Yamanashi
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23659519/
• 关键词: ゲノム; 遺伝子; 精神発達障害; 双生児; 次世代シーケンサー; エピジェネティクス; エピゲノム; 自閉症; 神経疾患; 双子; レット症候群; 比較; 精神発達; シーケンサー

Discordance in disease manifestation between affected monozygotic twins has been attributed to either environmental factors or different patterns of X chromosome inactivation (XCI). However, recent studies have identified genetic and epigenetic differences between monozygotic twins, thereby challenging the accepted experimental model for distinguishing the effects of nature andnurture. Here, we report the genomic and epigenomic sequences in skin fibroblasts of a discordant monozygotic twin pair with Rett syndrome, an X-linked neurodevelopmental disorder characterized by autistic features, epileptic seizures, gait ataxia and stereotypical hand movements. In the twins, no reproducible differences were detected between the twins in single nucleotide polymorphisms (SNPs), insertion-deletion polymorphisms (indels), or copy number variations. Differences in DNA methylation between the twins were detected in fibroblasts in the upstream regions of genes involved in brain function and skeletal tissues, and thus, the differences in DNA methylation patterns likely underlie the discordance in Rett phenotypes between the twins.

受影响的单卵双胞胎之间疾病表现的不一致性归因于环境因素或X染色体失活（XCI）的不同模式。然而，最近的研究已经确定了单卵双胞胎之间的遗传和表观遗传差异，从而挑战了公认的区分先天和后天影响的实验模型。在这里，我们报告的基因组和表观基因组序列在皮肤成纤维细胞的不和谐的单卵双胞胎与Rett综合征，一个X连锁的神经发育障碍的特点是自闭症的功能，癫痫发作，步态共济失调和刻板的手部运动。在双胞胎中，在单核苷酸多态性（SNPs），插入-缺失多态性（indels）或拷贝数变异方面没有检测到可重复的差异。在涉及脑功能和骨骼组织的基因上游区域的成纤维细胞中检测到双胞胎之间DNA甲基化的差异，因此，DNA甲基化模式的差异可能是双胞胎之间Rett表型不一致的基础。

项目成果

母子分離ストレスによるマウス脳海馬領域のグルココルチコイド受容体の発現変化

母婴分离应激导致小鼠大脑海马区糖皮质激素受体表达的变化

• 发表时间: 2012
• 作者: 平澤孝枝;石田哲史;田原佑里子;三宅邦夫;久保田健夫
• 通讯作者: 久保田健夫

プラダーウィリー症候群の遺伝子検査：診断確定と治療法選択への貢献.

普瑞德威利综合征的基因检测：对诊断确认和治疗选择的贡献。

• 发表时间: 2012
• 作者: 久保田健夫;根元篤;中根貴弥.
• 通讯作者: 中根貴弥.

No evidence of genetic difference for clinical severity between monozygotic twins with Rett syndrome.

没有证据表明患有雷特综合征的同卵双胞胎之间的临床严重程度存在遗传差异。

• 发表时间: 2012
• 作者: Kubota T;Miyake K;Hirasawa T;Minakuchi Y;Toyoda A.
• 通讯作者: Toyoda A.

Kubota T, Miyake K, Hirasawa T.Epigenetic understanding of gene-environment interactions in psychiatric disorders: a new concept of clinical genetics.

Kubota T，Miyake K，Hirasawa T.精神疾病基因-环境相互作用的表观遗传学理解：临床遗传学的新概念。

• 发表时间: 2012
• 期刊: Clin Epigenetics
• 影响因子: 5.7
• 作者: Kubota T;Miyake K;Hirasawa T
• 通讯作者: Hirasawa T

特別講演「エピジェネティクス～小児の発達に関わる新しい遺伝学的メカニズム～」.

特别讲座“表观遗传学：与儿童发育相关的新遗传机制”。

• 发表时间: 2012
• 作者: Ma;F.;et al.;久保田健夫
• 通讯作者: 久保田健夫