Phosphoproteomic analysis of clinical colon cancer specimen and validation by SRM/MRM analysis.

临床结肠癌标本的磷酸化蛋白质组学分析和 SRM/MRM 分析验证。

• 批准号: 23701093
• 负责人: SHIROMIZU Takashi
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: 独立行政法人医薬基盤研究所
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23701093/
• 关键词: 大腸癌; プロテオミクス; バイオマーカー

We performed mass spectrometry-based quantitative phosphoproteomic analysis to search for biomarker candidates by using surgically extracted colorectal cancer tissues. Novel biomarker candidates were identified by optimization of analysis conditions. For the selection of candidate genes, pathway analysis and comparison with the results of metastatic cancer cell lines were performed. Also by in vitro invasion assay, we have identified a novel functional molecule involved in cancer invasion.

我们进行了基于质谱的定量磷酸化蛋白质组学分析，通过使用手术提取的结直肠癌组织来搜索生物标志物候选者。通过优化分析条件鉴定了新的生物标志物候选物。对于候选基因的选择，进行通路分析并与转移癌细胞系的结果进行比较。此外，通过体外侵袭试验，我们已经确定了一种新的功能分子参与癌症的侵袭。

项目成果

Phosphoproteomic analysis of clinical colon cancer specimen for exploring a novel factor involved in cancer metastasis

临床结肠癌标本的磷酸化蛋白质组学分析，探索癌症转移的新因素

• 发表时间: 2011
• 作者: Hajime Sunagozaka;Tatsuya Yamashita;Kuniaki Arai;Shuichi Kaneko;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;砂子阪肇，篁 俊成，金子周一;砂子阪肇，本多政夫，金子周一;砂子阪肇，山下竜也，水腰英四郎，金子周一;砂子阪 肇，山下 竜也，北原 征明，荒井 邦明，金子 周一;砂子阪肇，山下竜也，北原征明，荒井邦明，金子周一;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;Hajime Sunagozaka， Tatsuya Yamashita，Kuniaki Arai，Shuichi Kaneko;砂子阪 肇，山下 竜也，北原 征明，荒井 邦明，金子 周一;Takashi Shiromizu;白水 崇;Takashi Shiromizu;白水 崇;Takashi Shiromizu;Takashi Shiromizu;白水 崇;Takashi Shiromizu;白水 崇
• 通讯作者: 白水 崇

Identification of missing proteins in the neXtProt database and unregistered phosphopeptides in the PhosphoSitePlus database as part of the Chromosome-centric Human Proteome Project.

• DOI: 10.1021/pr300825v
• 发表时间: 2013-01
• 期刊: Journal of proteome research
• 影响因子: 4.4
• 作者: Takashi Shiromizu;J. Adachi;S. Watanabe;T. Murakami;T. Kuga;S. Muraoka;T. Tomonaga

Phosphoproteomic analysis of clinical colon cancer specimen; Exploring a novel factor of cancer metastasis

临床结肠癌标本的磷酸化蛋白质组学分析；

• 发表时间: 2011
• 作者: Hajime Sunagozaka;Tatsuya Yamashita;Kuniaki Arai;Shuichi Kaneko;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;砂子阪肇，篁 俊成，金子周一;砂子阪肇，本多政夫，金子周一;砂子阪肇，山下竜也，水腰英四郎，金子周一;砂子阪 肇，山下 竜也，北原 征明，荒井 邦明，金子 周一;砂子阪肇，山下竜也，北原征明，荒井邦明，金子周一;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;Hajime Sunagozaka， Tatsuya Yamashita，Kuniaki Arai，Shuichi Kaneko;砂子阪 肇，山下 竜也，北原 征明，荒井 邦明，金子 周一;Takashi Shiromizu;白水 崇;Takashi Shiromizu;白水 崇;Takashi Shiromizu;Takashi Shiromizu;白水 崇;Takashi Shiromizu
• 通讯作者: Takashi Shiromizu

Quantitative proteomic profiling of orthotopic xenograft mouse model of colorectal cancer metastasis

结直肠癌转移原位异种移植小鼠模型的定量蛋白质组学分析

• 发表时间: 2012
• 作者: Hajime Sunagozaka;Tatsuya Yamashita;Kuniaki Arai;Shuichi Kaneko;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;砂子阪肇，篁 俊成，金子周一;砂子阪肇，本多政夫，金子周一;砂子阪肇，山下竜也，水腰英四郎，金子周一;砂子阪 肇，山下 竜也，北原 征明，荒井 邦明，金子 周一;砂子阪肇，山下竜也，北原征明，荒井邦明，金子周一;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;Hajime Sunagozaka， Tatsuya Yamashita，Kuniaki Arai，Shuichi Kaneko;砂子阪 肇，山下 竜也，北原 征明，荒井 邦明，金子 周一;Takashi Shiromizu;白水 崇;Takashi Shiromizu
• 通讯作者: Takashi Shiromizu

Proteomic analysis of highly metastatic colorectal cancer cells established from orthotopic metastatic mouse model.

对原位转移小鼠模型建立的高度转移性结直肠癌细胞进行蛋白质组学分析。

• 发表时间: 2012
• 作者: Hajime Sunagozaka;Tatsuya Yamashita;Kuniaki Arai;Shuichi Kaneko;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;砂子阪肇，篁 俊成，金子周一;砂子阪肇，本多政夫，金子周一;砂子阪肇，山下竜也，水腰英四郎，金子周一;砂子阪 肇，山下 竜也，北原 征明，荒井 邦明，金子 周一;砂子阪肇，山下竜也，北原征明，荒井邦明，金子周一;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;砂子阪肇 山下竜也 荒井邦明 金子周一;Hajime Sunagozaka， Tatsuya Yamashita，Kuniaki Arai，Shuichi Kaneko;砂子阪 肇，山下 竜也，北原 征明，荒井 邦明，金子 周一;Takashi Shiromizu;白水 崇;Takashi Shiromizu;白水 崇;Takashi Shiromizu
• 通讯作者: Takashi Shiromizu