A hybrid extended ensemble simulation study on the folding process of proteins

蛋白质折叠过程的混合扩展系综模拟研究

• 批准号: 24570189
• 负责人: YONEZAWA Yasushige
• 金额: $ 3.49万
• 依托单位: Kinki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24570189/
• 关键词: 蛋白質; 分子シミュレーション; 拡張アンサンブル法; 蛋白質構造; 反応座標; 構造空間探索; 蛋白質フォールディング; フォールディング; 分子動力学シミュレーション

项目成果

Molecular Dynamics Study of the Phosphorylation Effect on the Conformational States of the C-terminal Domain of RNA Polymerase II

RNA聚合酶II C端结构域磷酸化效应的分子动力学研究

• DOI: 10.1021/jp4101976
• 发表时间: 2014
• 期刊: J. Phys. Chem. B
• 作者: 西田 直哉;大前 英司;楯 真一;Y.Yonezawa
• 通讯作者: Y.Yonezawa

Electrostatic properties of water models evaluated by a long-range potential based solely on the Wolf charge-neutral condition

仅基于 Wolf 电荷中性条件通过远程电位评估水模型的静电特性

• DOI: 10.1016/j.cplett.2012.12.028
• 发表时间: 2013
• 期刊: Chemical Physics Letter
• 作者: Yukihiro Kyan;Yumi Ueda;Mitsutaka Yoshida;Kenji Sasahara;Kyoko Shinya;Yasushige Yonezawa
• 通讯作者: Yasushige Yonezawa

HPC と 蛋白質分子計算科学シミュレーション

HPC 和蛋白质分子计算科学模拟

• 发表时间: 2014
• 作者: Sasahara K;Goto Y;米澤康滋
• 通讯作者: 米澤康滋

分子動力学シミュレーションによる真核生物RNAポリメラーゼIIのC末端領域の構造特性の研究

利用分子动力学模拟研究真核 RNA 聚合酶 II C 末端区域的结构特性

• 发表时间: 2014
• 作者: 宮下由里奈;大前英司;楯真一;仲宗根薫;米澤康滋
• 通讯作者: 米澤康滋